論文 - 田中 尚人
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An e-Workbench for the study of microbial diversity: the system design and basic functions. (微生物多様性解析ツール InforBIO) 査読あり
菅原 秀明、宮崎 智、田中 尚人
Microbiol. Cult. Coll. 19 59 - 67 2003年06月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
微生物分類のためのあらゆる生物情報をデータベース化及び解析を可能としたスタンドアローンの微生物分類同定支援ツール InforBIO の開発についての報告。微生物の生理生化学的性状や化学分類学的性状、遺伝子配列データの管理を可能とし、CSV や XML 形式での出力を可能とした。これらのデータに基づいて数値分類解析、系統解析など様々な分類学的に必要な機能を装備した。
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The status quo of microbial genomic data available in the public domain: archaea and bacteria. (公開ゲノムの統計)
田中 尚人、平畠 壮規、宮崎 智、菅原 秀明
WFCC Newsletter 36 13 - 18 2002年12月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
2002年に国際塩基配列データベース (INSDC: DDBJ/GenBank/EMBL) に登録されている細菌およびアーキアのゲノムデータの統計情報についての報告。報告内容は登録菌種の系統解析を行い、対象微生物の系統群を調査し、また分離源の種類、例えば臨床株、自然環境株など、ゲノム解析の目的についての考察を記載し、微生物ゲノムの研究の今後の方向性について考察した。
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Isolation of Arthrobacter strains with their cystite formation. (Cystites 形成能を利用した Arthrobacter 属細菌の分離) 査読あり
田中 尚人、内村 泰、駒形 和男
J. Gen. Appl. Microbiol. 48 167 - 171 2002年02月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
系統的に cystites を形成するのは Arthrobacter 属の中でも A. globiformis group に含まれる種のみで、他属においてもそのような形成は見られない。また、形成条件の栄養ストレスはかなり生育に厳しい条件である。この条件で分離を行うと、cystites 形成能を有する Arthrobacter 属細菌が高頻度で得られることを本論文で報告した。
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The formation and structures of cystites of Arthrobacter ureafaciens NRIC 0157T induced by antibiotics. (Arthrobacter ureafaciens NRIC 0157T の cystites 形成と構造変化) 査読あり
田中 尚人、内村 泰、駒形 和男
J. Gen. Appl. Microbiol. 47 85 - 97 2001年04月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Arthrobacter ureafaciens NRIC 0157 が栄養的ストレスに加えて、テトラサイクリンなどタンパク合成阻害抗生物質によっても cystites を形成することを明らかにした。また、通常の細胞と cystites の状態の細胞構造を電子顕微鏡観察および成分分析により比較したところ、細胞壁成分のペプチドグリカン合成が遅延することで細胞壁が薄くなり細胞内容物の物理的圧力に耐えられず膨らんだ異常細胞であることが推定された。
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「Arthrobacter 属細菌のcystites形成について (博士論文)」
田中 尚人
東京農業大学 2001年03月
記述言語：日本語 掲載種別：学位論文（その他）
Arthrobacter ureafaciens NRIC 0157 が栄養的ストレスに加えて、テトラサイクリンなどタンパク合成阻害抗生物質によっても cystites を形成する現象を明らかにした。そして、通常の細胞と cystites の状態の細胞構造を電子顕微鏡観察および成分分析により比較したところ、細胞壁成分のペプチドグリカン合成が遅延することで細胞壁が薄くなり細胞内容物の物理的圧力に耐えられず膨らんだ異常細胞であることが推定された。
系統的に cystites を形成するのは Arthrobacter 属の中でも A. globiformis group に含まれる種のみで、他属においてもそのような形成は見られない。また、形成条件の栄養ストレスはかなり生育に厳しい条件である。
しかし、形成条件で分離を行うと、cystites 形成能を有する Arthrobacter 属細菌が高頻度で得られることも報告した。 -
The cystite formation of Arthrobacter ureafaciens NRIC 0157T. (Artheobacter ureafaciens NRIC 0157T の cystites 形成について) 査読あり
田中 尚人、内村 泰、駒形 和男
J. Gen. Appl. Microbiol. 46 167 - 178 2000年09月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Arthrobacter 属細菌は生活環で多型性を示すが、長期培養などにより偶発的に数倍の大きさの細胞の cystites といわれる状態になることが知られていた。本研究では窒素源とミネラルのアンバランスによる栄養的ストレスがその cystites 形成を誘導することを明らかにし、形成率を100%にすることを可能とした。また、本属の中でも細胞壁ペプチドグリカン組成が A3αタイプのみが形成し、進化系統的関係を反映した現象であることを明らかにした。
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「Arthrobacter 属細菌のcystites形成に関する研究 (修士論文)」
田中 尚人
東京農業大学 1998年03月
記述言語：日本語 掲載種別：学位論文（その他）
Arthrobacter 属細菌は生活環で多型性を示すが、長期培養などにより偶発的に数倍の大きさの細胞の cystites といわれる状態になることが知られていた。本研究では窒素源とミネラルのアンバランスによる栄養的ストレスがその cystites 形成を誘導することを明らかにし、形成率を100%にすることを可能とした。また、本属の中でも細胞壁ペプチドグリカン組成が A3αタイプのみが形成し、進化系統的関係を反映した現象であることを明らかにした。