Papers - WATANABE Satoru
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Constitutive expression of phosphoketolase, a key enzyme for metabolic shift from homo- to hetero-lactic fermentation in Enterococcus mundtii QU 25. Reviewed
Nabeta K, Watanabe S, Chibazakura T, Zendo T, Sonomoto K, Shimizu-Kadota M, Yoshikawa H.
Bioscience of Microbiota, Food and Health in press ( in press ) in press - in press 2019.05
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Coordination of Polyploid Chromosome Replication with Cell Size and Growth in a Cyanobacterium. Reviewed
Ohbayashi R, Nakamachi A, Hatakeyama TS, Watanabe S, Kanesaki Y, Chibazakura T, Yoshikawa H, Miyagishima SY.
mBio. 23 ( 10 ) e00510 - e00519 2019.04
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Integration of a Galdieria plasma membrane sugar transporter enables heterotrophic growth of the obligate photoautotrophic red alga Cynanidioschyzon merolae. Reviewed
Fujiwara T, Hirooka S,Mukai M,Ohbayashi R, Kanesaki Y, Watanabe S, Miyagishima SY.
Plant direct 3 ( 4 ) e00134 2019.04
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Synthetic Phosphorus Metabolic Pathway for Biosafety and Contamination Management of Cyanobacterial Cultivation Reviewed
Motomura K, Sano K, Watanabe S, Kanbara A, Gamal Nasser AH, Ikeda T, Ishida T, Funabashi H, Kuroda A, Hirota. R
ACS Synthetic Biology 7 ( 9 ) 2189 - 2198 2018.09
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Essentiality of WalRK for growth in Bacillus subtilis and its role during heat stress
Takada H, Shiwa Y, Takino Y, Osaka N, Ueda S, Watanabe S, Chibazakura T, Su'etsugu M, Utsumi R, Yoshikawa H
Microbiology 164 ( 4 ) 670 - 684 2018.04
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Draft Genome Sequence of the Nitrogen-Fixing and Hormogonia-Inducing Cyanobacterium Nostoc cycadae Strain WK-1, Isolated from the Coralloid Roots of Cycas revoluta. Reviewed
Kanesaki Y, Hirose M, Hirose Y, Fujisawa T, Nakamura Y, Watanabe S, Matsunaga S, Uchida H, Murakami A.
Genome Announc. 6 ( 7 ) e00021-18 2018.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Draft Genome Sequence of the Nitrogen-Fixing and Hormogonia-Inducing Cyanobacterium Nostoc cycadae Strain WK-1, Isolated from the Coralloid Roots of Cycas revoluta.
Kanesaki Y, Hirose M, Hirose Y, Fujisawa T, Nakamura Y, Watanabe S, Matsunaga S, Uchida H, Murakami A
Genome Announcement 15 ( 6 ) e00021 - e00018 2018.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Carbon-free production of 2-deoxy-scyllo-inosose (DOI) in cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942. Reviewed
Watanabe S, Ozawa H, Kato H, Nimura-Matsune K, Hirayama T, Kudo F, Eguchi T, Kakinuma K, Yoshikawa H.
Biosci Biotechnol Biochem. 82 ( 1 ) 161 - 165 2018.01
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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A carbon dioxide limitation-inducible protein, ColA, supports the growth of Synechococcus sp. PCC 7002
Shimakawa G, Watanabe S, Miyake C
Marine drugs 15 ( 12 ) 390 2017.12
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： 10.3390/md15120390.
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ParA-like protein influences the distribution of multi-copy chromosomes in cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942.
Watanabe S, Noda A, Ohbayashi R, Uchioke K, Kurihara A, Nakatake S, Morioka S, Kanesaki Y, Chibazakura T, Yoshikawa H
Microbiology 164 ( 1 ) 45 - 56 2017.11
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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The nitrogen-regulated response regulator NrrA is a conserved regulator of glycogen catabolism in β-cyanobacteria. Reviewed
Ehira S, Shimmori Y, Watanabe S, Kato H, Yoshikawa H, Ohmori M.
Microbiology in press 2017.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Transposition of insertion sequence IS256Bsu1 in Bacillus subtilis 168 is strictly dependent on recA
Akashi M, Harada S, Moki S, Okouji Y, Takahashi K, Kada S, Yamagami K, Sekine Y, Watanabe S, Chibazakura T, Yoshikawa H
Genes Genet Syst. 18 ( 92 ) 59 - 71 2017.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Conserved two-component Hik34-Rre1 module directly activates heat-stress inducible transcription of major chaperone and other genes in Synechococcus elongatus PCC 7942. Reviewed
Kobayashi I, Watanabe S, Kanesaki Y, Shimada T, Yoshikawa H, Tanaka K.
Molecular Microbiology 104 ( 2 ) 260 - 277 2017.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： 10.1111/mmi.13624.
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Variety of DNA replication activity among cyanobacteria correlates with distinct respiration activity in the dark Reviewed
Ohbayashi R, Yamamoto J, Watanabe S, Kanesaki Y, Chibazakura T, Miyagishima S, and Yoshikawa H
Plant Cell Physiology 58 ( 2 ) 279 - 586 2017.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
光合成によって生育するシアノバクテリアはDNAの複製も光に依存している。本論文では異なる3種のシアノバクテリアについて、光への依存度を比較した。淡水性シアノバクテリアのSynechocystis sp. PCC 6803, Anabaena sp. PCC 7120は暗所においても若干の複製活性が検出された。生化学的、遺伝学的な解析から、暗所での複製活性はグリコーゲンの代謝によることが新たに示された。
DOI： 10.1093/pcp/pcw186.
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CyanoBase: a large-scale update on its 20th anniversary. Reviewed
Fujisawa T, Narikawa R, Maeda SI, Watanabe S, Kanesaki Y, Kobayashi K, Nomata J, Hanaoka M, Watanabe M, Ehira S, Suzuki E, Awai K, Nakamura Y.
Nucleic Acids Res. 45 ( D1 ) D551 - D554 2016.11
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： 10.1093/nar/gkw1131.
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Awakening of a Dormant Cyanobacterium from Nitrogen Chlorosis Reveals a Genetically Determined Program. Reviewed
Klotz A, Georg J, Bučinská L, Watanabe S, Reimann V, Januszewski W, Sobotka R, Jendrossek D, Hess WR, Forchhammer K.
Current biology 2016.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
微生物の休眠状態から増殖状態への遷移については、未だに不明な点が多い。本研究では、窒素源枯渇処理で休眠したシアノバクテリアの復帰についてその表現型と分子メカニズムを解析した。その結果、休眠状態からの復帰はいくつかのフェーズに分けられることが明らかとなった。
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A tightly inducible riboswitch system in Synechocystis sp. PCC 6803 Reviewed
Ohbayashi R, Akai H, Yoshikawa H, Hess WR, Watanabe S.
The Journal of General and Applied Microbiology 2016.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803は世界で4番目に全ゲノム配列が決定された生物であり、光合成のモデル生物として世界中で研究されてきた。遺伝子組換えが可能であり、外来遺伝子導入や遺伝子破壊が可能な一方で、遺伝子の誘導発現系に関しては改良の余地が残されていた。そこでリボスイッチによる厳密な遺伝子発現制御系を構築した。本研究で用いたリボスイッチはテオフィリン依存的にmRNAの二次構造が変化し、SD配列が露出することにより翻訳が開始される。このスイッチを緑色蛍光タンパク質GFPに連結しS. 6803細胞内での制御について解析•評価を行った。その結果、テオフィリンに完全に依存した発現制御を確認した。S. 6803を始めとするシアノバクテリアは物質生産のホストとしても期待されており、本遺伝子発現系は基礎研究だけでなく応用研究への利用も期待できる。
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Diversification of DnaA dependency for DNA replication in cyanobacterial evolution Reviewed
Ohbayashi R, Watanabe S, Ehira S, Kanesaki Y, Chibazakura T, and Yoshikawa H
The ISME Journal 10 ( 5 ) 1113 - 1121 2016.05
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
バクテリアの増殖においてDNA複製の開始はDnaAという複製開始因子によって制御される。複製の開始は細胞周期において最も重要な制御点であるためDnaAタンパク質はバクテリアにとって必須である。細胞辺り複数コピーのゲノムを持つ淡水性シアノバクテリアの3種においてDnaAの必須性について、解析を行った結果、2種では全く必須ではないのに対し、1種ではDnaAは必須であり、その欠損は内在性プラスミドによって相補されるということが明らかとなった。この結果は淡水性シアノバクテリアがDnaAに依存しない多様な複製開始制御機構を有するということを示唆している。
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Community analysis of picocyanobacteria in an oligotrophic lake by cloning 16S rRNA gene and 16S rRNA gene amplicon sequencing Reviewed
Fujimoto N, Mizuno K, Yokoyama T, Ohnishi A, Suzuki M, Watanabe S, Komatsu K, Sakata Y, Kishida N, Akiba M, and Matsukura S
The Journal of General and Applied Microbiology 2015.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ピコシアノバクテリアは様々な環境下に生息し地球環境の維持に大きく貢献している。その一方で日本においてはダム湖で大量に発生することがあり、これにより水質の悪化が懸念される。本研究では神奈川県の宮ヶ瀬湖のピコシアノバクテリア種について解析を行った。その結果、宮ヶ瀬湖に特徴的なピコシアノバクテリア群を新たに同定した。
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Construction of a URA5.3 deletion strain of the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae: A backgroundless host strain for transformation experiments Reviewed
Taki K, Sone T, Kobayashi Y, Watanabe S, Imamura S, and Tanaka K
The Journal of General and Applied Microbiology 2015.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Cyanidioschyzon merolaeは単純な細胞構造、ゲノムを有する単細胞性紅藻であり、植物細胞を理解するためのモデルとして期待されている生物である。これまでにC. merolaeでは外来遺伝子を導入する際にURA5.3遺伝子の点変異株を用いて研究が行われてきたが、この株は遺伝的に不安定であった。本論文ではC. merolaeのURA5.3遺伝子を完全に欠失した株の取得と、その利用について報告を行った。新たな株は遺伝的にも安定であり、今後のC. merolae研究をさらに加速させると期待出来る。