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横田 健治 (ヨコタ ケンジ) YOKOTA Kenji 教授 |
出身大学院 【 表示 ／ 非表示 】
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東北大学 農学研究科 農芸化学専攻 博士後期課程 修了
1996年04月 - 2000年03月
国名：日本国
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東京農業大学 農学研究科 醸造学専攻 修士課程 修了
1994年04月 - 1996年03月
国名：日本国
学内職務経歴 【 表示 ／ 非表示 】
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東京農業大学 応用生物科学部 生物応用化学科 助手
2001年04月 - 2007年03月
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東京農業大学 応用生物科学部 生物応用化学科 助教
2007年04月 - 2012年09月
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東京農業大学 応用生物科学部 生物応用化学科 准教授
2012年10月 - 2018年03月
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東京農業大学 応用生物科学部 農芸化学科 准教授
2018年04月 - 2019年03月
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東京農業大学 応用生物科学部 農芸化学科 教授
2019年04月 - 現在
論文 【 表示 ／ 非表示 】
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Involvement of iturin and surfactin in inhibition of a post-harvest fungal pathogen on green bell pepper 査読あり 国際共著 国際誌
Yuliar, Shun Tomita, Hinako Hishinuma, Kenji Yokota
Journal of Plant Protection Research 2025年03月
担当区分：最終著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
This study aimed to investigate the potential of plant-associated bacteria as bio-control agents for the green bell pepper rot lesion caused by Colletotrichum scovillei 244830. A total of 378 bacteria strains isolated from stems and leaves of healthy red chili and tomato were tested for their antagonistic potential. Isolate TS001 associated with tomato stems was identified as Bacillus spp. It was found that TS001 showed remarkable inhibition to C. scovillei 244830 in in vitro and in vivo tests. TS001 significantly reduced rot lesions (P<0.05) of fresh green bell pepper fruits by 71.43%. Furthermore, the result of the LC-ESI-MS/MS showed that the culture broth of the strain Bacillus sp. TS001 contained iturin and surfactin homolog in No. 3S medium. TS001 exhibited the strongest antagonistic activity that effectively suppressed C. scovillei 244830 rot lesion. -
Characterization of NRPS operon homologue for surfactin synthesis distributed in Bacillus spp. 査読あり 国際誌
Kojiro Ito, Mana Adachi, Minenosuke Matsutani, Ryota Kataoka, Gen Enomoto, Akinobu Kajikawa, Kenji Yokota
Archives of Microbiology 2025年
担当区分：最終著者, 責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Surfactin is a cyclic lipopeptide consists of a b-hydroxy fatty acid and a heptapeptide derived from Bacillus spp. The heptapeptide moiety of surfactin is synthesized by non-ribosomal peptide synthetases, and a variety of surfactin congeners which are varied by substitution of amino acid in the heptapeptide have been identified so far. Surfactin A, B and C are surfactin congeners which are substituted of Leu7 of surfactin A with Val for surfactin B or Ile for surfactin C. The operon encoding non-ribosomal peptide synthetases for surfactin A had been identified in B. subtilis JH 642. Here, we report that novel operons encoding non-ribosomal peptide synthetases for surfactin A and C biosynthesis, respectively.
The srfA operon for surfactin A biosynthesis in B. subtilis composed by 4-ORFs, srfAABCD. The novel operon for surfactin A biosynthesis was distinct from the srfA operon in B. subtilis JCM 1465 with 68.5, 69.2, 84.5 and 66.9 % homology of ORFs, respectively. The novel surfactin C showed 68.7, 69.3, 64.5 and 67.2 % homology with srfA operon in B. subtilis JCM 1465, respectively, and the adenylation domain to select Ile7 in surfactin C was identified by a domain substitution in srfA operon in a surfactin A-producing strain. Average Nucleotide Identity of genomic sequence of tested strains clearly showed that the novel operons for surfactin A and C biosynthesis are distributed in B. velezensis and B. amyloliquefaciens, respectively. Our results indicate surfactin congener production was strictly related to the species level of Bacillus and srf operon was suggested to be distributed by species. -
TAMAKI Mizuna, CHIKU Tsutomu, SUZUKI Shunya, MISAKI Aya, FUNAKUBO Asuka, MATSUSHIMA Yoshitaka, YOKOTA Kenji, IGIMI Shizunobu, KAJIKAWA Akinobu
Bioscience of Microbiota, Food and Health 44 ( 1 ) 70 - 79 2024年09月
記述言語：英語 出版者・発行元：BMFH Press
Although the clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)-Cas system has been extensively developed since its discovery for eukaryotic and prokaryotic genome editing and other genetic manipulations, there are still areas warranting improvement, especially regarding bacteria. In this study, BRD0539, a small-molecule inhibitor of Streptococcus pyogenes Cas9 (SpCas9), was used to suppress the activity of the nuclease during genetic modification of Lacticaseibacillus paracasei, as well as to regulate CRISPR interference (CRISPRi). First, we developed and validated a CRISPR-SpCas9 system targeting the sirA gene of L. paracasei. Then BRD0539 was used for CRISPR-dependent DNA cleavage in vivo. Our results suggested that the inhibitor worked partially in both Escherichia coli and L. paracasei. Next, we designed a CRISPRi system in a L. paracasei strain by inserting an inactive SpCas9 gene into the chromosome and introducing a plasmid encoding for a single guide RNA (sgRNA) targeting the sirA gene. Expression of sirA was successfully inhibited in the recombinant strains, and CRISPRi was abolished in an inhibitor-dependent manner. Our findings may help expand the CRISPR toolbox for research on lactic acid bacteria and other microbes.
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Heat-stable spores of carotenoid-producing Bacillus marisflavi and non-pigmented Bacillus subtilis cooperatively promote growth, quality, and gut microbiota of white-leg shrimp 査読あり 国際共著 国際誌
T.T. Nguyen, A.T.P. Bui, N.T.H. Le, H.T. N. Vo, A.H. Nguyen, T.D. Pham, T. Hara, K. Yokota, M. Matsutani, Y. Takatsuka, A.T.V. Nguyen
Beneficial Microbes 2023年11月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
We evaluated the benefits of heat-stable carotenoid-producing Bacillus marisflavi SH8 spores individually and in combination with non-pigmented Bacillus subtilis SH23 spores on growth, colour change, nutritional content, innate immunity, and gut microbiota of white-leg shrimp. White-leg shrimp (Litopenaeus vannamei; n = 30 per tank; 2 tanks per group) were provided feed without (control group) or with SH8, SH23, or mixed spores (total, 1×106 cfu/g pellet) for 28 d. The SH8 and SH8-23 combination groups had significantly higher specific growth rates (9.6 and 11.0%), improved red-colour score (4 scores), astaxanthin concentration (1.8- and 2.3-fold), lipid contents (30 and 50%), and superoxidase dismutase activity (8.5 and 12.3%) than that of the control group. Analysis of shrimp’s gut microbiome using 16S rRNA metagenome sequencing revealed increased abundance of four useful species and reduced abundance of four harmful species in the combination group than in the control group. Heat-stable Bacillus spore combination improved growth parameters, nutrient content, red-colour score, live counts, and abundance of useful bacteria in the gut of L. vannamei. This is the first study to show the benefits of combining highly heat-stable pigmented and non-pigmented Bacillus spores and their possible mechanisms in a shrimp model.
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Negative chemotaxis of Ligilactobacillus agilis BKN88 against gut-derived substances 査読あり 国際誌
Shunya Suzuki, Kenji Yokota, Shizunobu Igimi, Akinobu Kajikawa
Scientific Reports 13 2023年09月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Ligilactobacillus agilis is a motile lactic acid bacterium found in the gastrointestinal tracts of animals. The findings of our previous study suggest that the motility of L. agilis BKN88 enables gut colonization in murine models. However, the chemotactic abilities of motile lactobacilli remain unknown. This study aimed to identify the gut-derived chemoeffectors and their corresponding chemoreceptors in L. agilis BKN88. Chemotaxis assays with chemotactic and non-chemotactic (ΔcheA) L. agilis strains revealed that low pH, organic acids, and bile salts served as repellents. L. agilis BKN88 was more sensitive to bile and acid than the gut-derived non-motile lactobacilli, implying that L. agilis might utilize motility and chemotaxis instead of exhibiting stress tolerance/resistance. L. agilis BKN88 contains five putative chemoreceptor genes (mcp1–mcp5). Chemotaxis assays using a series of chemoreceptor mutants revealed that each of the five chemoreceptors could sense multiple chemoeffectors and that these chemoreceptors were functionally redundant. Mcp2 and Mcp3 sensed all tested chemoeffectors. This study provides further insights into the interactions between chemoreceptors and ligands of motile lactobacilli and the unique ecological and evolutionary features of motile lactobacilli, which may be distinct from those of non-motile lactobacilli.
書籍等出版物 【 表示 ／ 非表示 】
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太田寛行，森﨑久雄，大塚重人，渡邉健史，鮫島玲子，中川達功，佐伯雄一，礒井俊行，横田健治，豊田剛己，村瀬 潤，浦嶋泰文，藤井一至，原田直樹，西澤智康，浅川 晋，竹腰 恵（ 担当： 分担執筆）
朝倉書店 2018年08月 （ ISBN:978-4-254-43571-9 ）
総ページ数：208 担当ページ：80-87 記述言語：日本語 著書種別：学術書
植物生育促進根圏微生物について解説した。
担当執筆分：8. 有用微生物3―植物生育促進根圏微生物―
A5版 -
里山の自然とくらし 福島県鮫川村
入江 彰昭, 上地 由朗, 内田 均, 竹内 将俊, 舘 博, 安藤 達彦, 穂坂 賢, 高橋 悟, 渡邉 文雄, 川上 昭太郎, 栗田 和弥, 桝田 信彌, 伊藤 健, 入江 満美, 横田 健治（ 担当： 共著 , 範囲： p78-79、2頁）
東京農業大学出版会 2013年03月 （ ISBN:978-4-88694 ）
記述言語：日本語 著書種別：学術書
村内の田畑の土壌分析を行い、本地域の土壌の特性について解説した。四六判、P.112
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Sustainable Farming Practices for Environmental Conservation
Edited by Machito Mihara and Akimi Fujimoto（ 担当： 共著 , 範囲： 抽出不可能）
Institute of Environment Rehabilitation and Conservation, Japan 2009年04月 （ ISBN:4-916174-08-9 ）
記述言語：英語 著書種別：学術書
MISC 【 表示 ／ 非表示 】
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Pseudomonas tolaasiiによるきのこの細菌病害に対する生物的防除戦略 微生物の様々な機能を駆使してきのこを病気から守る 招待あり 査読あり
富田 駿、篠原 弘亮、横田 健治
化学と生物 116 - 124 2023年03月
担当区分：最終著者 記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
Pseudomonas tolaasiiによって引き起こされるきのこ類の細菌病害は国内外を問わず重要病害となる．本解説では，本病害に対する微生物の様々な機能を駆使した生物的防除戦略について，筆者らが取り組んできた研究を交えて紹介する．
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Bacillus属細菌を用いた植物病害生物防除における環状リポペプチドの機能 招待あり
横田 健治
日本農薬学会誌 47 ( 2 ) 124 - 125 2022年08月
担当区分：筆頭著者 記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
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きのこを褐変化させる毒素tolaasinを解毒する細菌 招待あり 査読あり
横田健治・富田駿・篠原弘亮
バイオサイエンスとインダストリー 79 ( 3 ) 214 - 215 2021年05月
担当区分：筆頭著者 記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
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拮抗性Bacillus属細菌を利用した植物病害の生物防除 機能性物質とその防除メカニズムを中心に
横田 健治
土と微生物 66 ( 1 ) 27 - 31 2012年04月
記述言語：日本語 掲載種別：記事・総説・解説・論説等（国際会議プロシーディングズ） 出版者・発行元：日本土壌微生物学会
拮抗性Bacillus属細菌を利用した植物病害の生物防除について報告した。
産業財産権 【 表示 ／ 非表示 】
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抗菌剤、農薬、微生物による植物病害の防除方法、および新規バチルス - サブティリス
原 富次郎, 高塚 由美子, 杉村 祐哉, 横田 健治
出願番号：WO2017150556A1 出願日：2017年02月
特許番号/登録番号：WO2017150556A1 登録日：2017年09月 発行日：2017年09月
出願国：国内 取得国：国内
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分生胞子増殖因子、分生胞子増殖因子を含む培地及び分生胞子増殖因子の製造方法
横田 健治
出願人：東京農業大学
出願番号：特願2008-263233(P2008-263233) 出願日：2008年10月
公開番号：特開2010-88380(P2010-88380A) 公開日：2010年04月
出願国：国内
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ANTIMICROBIAL AGENT, PESTICIDE, METHOD FOR PREVENTING PLANT DISEASE CAUSED BY MICROORGANISMS, AND NOVEL Bacillus subtilis
Tomijiro Hara, Yumiko Takatsuka, Yuya Sugimura, Kenji Yokota
出願番号：15579831
学術関係受賞 【 表示 ／ 非表示 】
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Best Oral Presenter
2022年11月 ISSAAS-SEAPPRO Joint International Seminar and Congress 2022
受賞区分：国際学会・会議・シンポジウム等の賞 受賞国：インドネシア共和国
科研費（文科省・学振）獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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病害土壌診断バイオマーカーの開発に向けたメタゲノム解析
2016年09月 - 2019年08月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
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地域資源活用型小規模持続的農業システムのためのアグロエコロジー研究
2016年04月 - 2019年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究分担者
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バチルス属菌由来の環状リポペプチドによるシロイヌナズナの病害抵抗性制御機構の解明
2016年04月 - 2019年03月
科学研究費補助金 基盤研究(C)
担当区分：研究代表者
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黄色ブドウ球菌の血球崩壊毒素の三次元構造解析による膜孔形成機構の解明
2000年04月 - 2001年03月
科学研究費補助金 特別研究員推奨費
黄色ブドウ球菌が生産する二成分性膜孔形成型毒素タンパク質γヘモリジンの構成分子LukF成分の赤血球細胞認識及び結合領域の解明
その他競争的資金獲得実績 【 表示 ／ 非表示 】
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Bacillus属が分泌生産する新規抗菌性環状リポペプチドの構造解析と抗菌活性評価
2020年04月 - 2021年03月
京都大学エネルギー理工学研究所
横田 健治
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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Bacillus属が分泌生産する新規抗菌性環状リポペプチドの構造解析と抗菌活性評価
2019年04月 - 2020年03月
京都大学エネルギー理工学研究所
横田 健治
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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インドネシアのマングローブ根圏から分離された各種拮抗性細菌の拮抗作用の解明
2018年11月 - 2019年02月
民間財団等
横田 健治
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
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Bacillus属菌の抗菌性リポペプチド生産を誘導する大豆由来の生理活性物質に関する研究
2010年05月 - 2011年04月
民間財団等 タカノ農芸化学研究助成財団 若手研究者部門
担当区分：研究代表者 資金種別：競争的資金
講演・口頭発表等 【 表示 ／ 非表示 】
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Microbacterium foliorum NBRC 103072Tによるtolaasin 解毒機構 -Tolaasin 加水分解酵素は菌体の界面 活性剤処理により可溶化する- 国際会議
富田 駿, 梶川揚申, 五十君靜信, 篠原弘亮, 横田健治
令和2 年度日本植物病理学会大会 2020年03月
開催年月日： 2020年03月
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）
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Susceptibility to Tolaasins on Tolaasin-Detoxyfying Microbacterium spp. 国際会議
Shun Tomita, Hirosuke Shinohara, Kenji Yokota
ISSAAS 2019 International Congress & General Meeting 2019 2019年10月
開催年月日： 2019年10月
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）
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Comparative Study of Surfactin Homologues on Antibacterial Activity 国際会議
Takafumi Yoshida and Kenji Yokota
ISSAAS 2019 International Congress & General Meeting 2019 2019年10月
開催年月日： 2019年10月
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）
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Arthrobacter sp. Isolate Enhance Fusarium Soil-Borne Disease 国際会議
Mana Adachi, Ryota Kataoka, Yusuke Yamamoto, Ryoko Kato, Kenji Yokota
ISSAAS 2019 International Congress & General Meeting 2019 2019年10月
開催年月日： 2019年10月
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）
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Analysis of the Inhibitory Effect of Bacterial Growth on Cabbage Leaves in Response to Treatment with Lipopeptides 国際会議
Carla Suzuki Altrão, Yusuke Yanai, Hirosuke Shinohara, Kenji Yokota
ISSAAS 2019 International Congress & General Meeting 2019 2019年10月
開催年月日： 2019年10月
記述言語：英語 会議種別：口頭発表（一般）