論文 - 徳岡 昌文
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Comprehensive analysis of dipeptides in alcoholic beverages by tag-based separation and determination using liquid chromatography/electrospray ionization tandem mass spectrometry and quadrupole-time of flight mass spectrometry (共著) 査読あり 国際誌
Takahashi K, Tokuoka M, Sawamura N, Kohno H, Myoken Y, Mizuno A. (イコールコントリビューション）
Journal of Chromatography A 1242 17 - 25 2012年06月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
酒類中の低分子ペプチドをLC/MSを用いて網羅的に分離・検出する方法として、AccQTagを用いたフラグメンテーションに基づく方法を報告した。本方法により、清酒中に新たに60種類のペプチドを見出すことに成功した。
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Transcripts of a heterologous gene encoding mite allergen der f 7 are stabilized by codon optimization in Aspergillus oryzae (共著) 査読あり 国際誌
Tanaka, M., Tokuoka, M., Shintani, T., Gomi, K
Applied Microbiology and Biotechnology 96 ( 5 ) 1275 - 1282 2012年05月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
麹菌において、異種遺伝子の発現においてコドンの最適化がmRNA量の増加につながるという現象について詳細に調べ、転写阻害剤を用いた解析から、コドンの最適化がmRNAの半減期を長くする効果があることを直接的に証明した。
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Genetic safeguard against mycotoxin cyclopiazonic acid production in Aspergillus oryzae. (共著) 査読あり 国際誌
Kato N, Tokuoka M, Shinohara Y, Kawatani M, Uramoto M, Seshime Y, Fujii I, Kitamoto K, Takahashi T, Takahashi S, Koyama Y, Osada H. (イコールコントリビューション）
Chembiochem 12 1376 - 1382 2011年05月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Aspergillus oryzaeはカビ毒であるシクロピアゾン酸の生合成経路をもつが、その経路はAspergillus flavusのものよりも長く、弱毒化する経路を持っている。すなわち、麹菌は進化的にカビ毒生産に対して、遺伝的に弱毒化経路を保持していることを明らかにした。
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Functional Analysis of the Cyclopiazonic Acid Biosynthesis Gene Cluster in Aspergillus oryzae RIB 40. (共著) 査読あり
Shinohara Y, Tokuoka M, Koyama Y (イコールコントリビューション）
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 75 ( 11 ) 2249 - 2252 2011年05月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
ゲノム解読が行われたAspergillus oryzae RIB40株にはシクロピアゾン酸の生合成経路の初発段階の触媒遺伝子が欠損しているにもかかわらず、その他の生合成経路は遺伝的にも機能的にも保持されていることを明らかにした。
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A trial of minimization of chromosome 7 in Aspergillus oryzae by multiple chromosomal deletions (共著) 査読あり
Jin FJ, Takahashi T, Utsushikawa M, Furukido T, Nishida M, Ogawa M, Tokuoka M, Koyama Y.
Molecular Genetics and Genomics 283 1 - 12 2010年10月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
染色体内での相同組換えを繰り返すことで、麹菌の7番染色体の約24%を欠失させた株の作製に成功した。この方法により、効率的な物質生産宿主の造成が可能になった。
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Simple metabolite extraction method for metabolic profiling of the solid-state fermentation of Aspergillus oryzae. (共著) 査読あり
Tokuoka M, Sawamura N, Kobayashi K, Mizuno A.
Journal of Bioscience and Bioengineering 110 ( 6 ) 665 - 669 2010年08月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
醸造において重要な役割を果たす米麹について、一斉成分分析を行うための、簡便な代謝産物の抽出方法を検討し、50%アセトニトリル水によりビーズによる破砕と酵素の熱失活をあわせた方法を構築した。
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Genetic analysis of conidiation regulatory pathways in koji-mold Aspergillus oryzae. (共著) 査読あり
Ogawa M, Tokuoka M, Jin FJ, Takahashi T, Koyama Y
Fungal Genetics and Biology 47 10 - 18 2010年01月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
ゲノム情報より他の生物で見出されている分生子形成に関係する遺伝子の破壊株を作製し、麹菌のもつ分生子形成の遺伝子ネットワークについて、他の糸状菌との類似点、相違点を示した。
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Alternative Processing of Proproteins in Aspergilli kexB Gene Disruptants under Hyperosmotic Conditions. (共著) 査読あり
Mizutani O, Furukawa K, Ichiyanagi S, Matsuda Y, Tokuoka M, Fujioka T, Yamagata Y, Gomi K, Abe K.
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 73 ( 1 ) 40 - 46 2009年09月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
麹菌のゴルジ体に存在するプロテアーゼ、KexBの遺伝子破壊株は、浸透圧ストレスにより、野生型の表現型を示す。KexB切断サイトをもつタンパク質の発現により、浸透圧ストレス下で、KexBと同じ機能を示すプロテアーゼの存在が示された。
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Functional expression of the Aspergillus flavus PKS-NRPS hybrid CpaA involved in the biosynthesis of cyclopiazonic acid. （共著） 査読あり
Seshime Y, Juvvadi PR, Tokuoka M, Koyama Y, Kitamoto K, Ebizuka Y, Fujii I.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 19 3288 - 3292 2009年04月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
麹菌で見出されたポリケタイドシンターゼ・ノンリボゾーマルシンテターゼについて、高発現株を作製して機能を解析した。この遺伝子はシクロピアゾン酸の生合成の一つ目の中間体の合成に関わっていることが示された。
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Codon optimization increases steady-state mRNA levels in Aspergillus oryzae heterologous gene expression.(共著) 査読あり
Tokuoka M, Tanaka M, Ono K, Takagi S, Shintani T, Gomi K.
Applied and Environmental Microbiology 74 ( 21 ) 6538 - 6546 2008年09月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
麹菌の高度な利用として、異種タンパク質の生産宿主としての利用が挙げられるが、異種遺伝子の転写量が減少することが観察されることがある。筆者らはコドン使用頻度の最適化を行うことが、異種遺伝子の転写量増加につながること、mRNA量減少は、ｍRNA品質管理機構であるnonstop RNA decay経路が原因であることを示唆した。
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Identification of a novel polyketide synthase-nonribosomal peptide synthetase (PKS-NRPS) gene required for the biosynthesis of cyclopiazonic acid in Aspergillus oryzae. (共著) 査読あり
Tokuoka M, Seshime Y, Fujii I, Kitamoto K, Takahashi T, Koyama Y.
Fungal Genetics and Biology 45 1608 - 1615 2008年09月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
味噌やチーズなどにおいて、汚染が報告されているシクロピアゾン酸の生合成遺伝子クラスターを麹菌において見出した。この遺伝子クラスターは非生産株においては、テロメアによる切断を受けていることがわかった他、アフラトキシンの生合成遺伝子クラスターと隣接しており、これら２つのカビ毒が、しばしば同時に検出されることの理由であることが示唆された。