Updated on 2022/08/30

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WATANABE Satoru

Associate Professor

Title

Associate Professor

External Link

From Graduate School 【 display / non-display

  • Tokyo University of Agriculture   Graduate School, Division of Agriculture   Doctoral program (second term)   Completed

    2004.04 - 2007.03

      More details

    Country:Japan

  • Tokyo University of Agriculture   Graduate School, Division of Agriculture   Doctoral program (first term)   Completed

    2002.04 - 2004.03

      More details

    Country:Japan

Studying abroad experiences 【 display / non-display

  • 2013.04 - 2014.03   Freiburg University  

Degree 【 display / non-display

  • 博士(バイオサイエンス) ( 2007.03   東京農業大学 )

Employment Record in Research 【 display / non-display

  • Tokyo University of Agriculture   Faculty of Applied Bio-Science   Department of Bio-Science   Assistant Professor

    2008.04 - 2016.03

  • Tokyo University of Agriculture   Faculty of Applied Bio-Science   Department of Bio-Science   Associate Professor

    2016.04 - 2017.03

  • Tokyo University of Agriculture   Faculty of Life Sciences   Department of Bioscience   Associate Professor

    2017.04

External Career 【 display / non-display

  • Rikkyo University   Researcher

    2014.07 - 2016.03

      More details

    Country:Japan

Research Areas 【 display / non-display

  • Life Science / Applied microbiology

Research seeds 【 display / non-display

  • 光合成微生物のゲノム工学

  • 光合成微生物を用いた有用物質生産

Papers 【 display / non-display

  • Conserved Two-Component Hik2-Rre1 Signalling is Activated Under Temperature Upshift and Plastoquinone-Reducing Conditions in the Cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942. Reviewed

    Bairagi N, Watanabe S, Nimura-Matsune K, Tanaka K, Tsurumaki T, Nakanishi S, Tanaka K.

    Plant Cell Physiol.   2021.11

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1093/pcp/pcab158.

  • Biosynthesis system of Synechan, a sulfated exopolysaccharide, in the model cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 Reviewed

    Maeda K, Okuda Y, Enomoto G, Watanabe S, Ikeuchi M

    eLife   2021.06

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

  • Identification of Transcription Factors and the Regulatory Genes Involved in Triacylglycerol Accumulation in the Unicellular Red Alga Cyanidioschyzon merolae Reviewed

    Takahashi S, Okubo R, Kanesaki Y, Zhou B, Takaya K, Watanabe S, Tanaka K, Imamura S

    Plants   10 ( 5 )   2021.05

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.3390/plants10050971

  • Visualization of the seasonal shift of a variety of airborne pollens in western Tokyo

    Uetake J, Tobo Y, Kobayashi S, Tanaka K, Watanabe S, DeMott PJ, Kreidenweis SM.

    Sci Total Environ.   20 ( 788 )   147623   2021.05

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1016/j.scitotenv.2021.147623.

  • Evolution of Ribosomal Protein S14 Demonstrated by the Reconstruction of Chimeric Ribosomes in Bacillus subtilis. Reviewed

    Akanuma G, Kawamura F, Watanabe S, Watanabe M, Okawa F, Natori Y, Nanamiya H, Asai K, Chibazakura T, Yoshikawa H, Soma A, Hishida T, Kato-Yamada Y.

    J Bacteriol.   203 ( 10 )   e00599   2021.04

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    DOI: 10.1128/JB.00599-20.

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Misc 【 display / non-display

  • Cyanobacterial multi-copy chromosomes and their replication. Invited Reviewed

    Watanabe S.

    Biosci Biotechnol Biochem.   84 ( 7 )   1309 - 1321   2020.03

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (bulletin of university, research institution)  

    DOI: 10.1080/09168451.2020.1736983.

Industrial Property Rights 【 display / non-display

  • 藍藻の培養方法および藍藻の変異株のスクリーニング方法

    廣田隆一、黒田章夫、菓子野康浩、菓子野名津子、渡辺智

     More details

    Application no:2021-148599  Date applied:2021.09

    Country of applicant:Domestic  

  • 単細胞性真核紅藻への遺伝子導入方法(ガルデリア)

    渡辺智、板谷光泰

     More details

    Application no:2020-076701  Date applied:2020.04

    Country of applicant:Domestic  

  • カーラクトン生産能を有するシアノバクテリアおよびそれを用いたカーラクトンの生産方法

    渡辺智、伊藤晋作、坂巻裕

     More details

    Application no:2020-22999  Date applied:2020.02

    Country of applicant:Domestic  

Honours, Awards and Prizes 【 display / non-display

  • 2018年 Biosci. Biotechnol. Biochem.論文賞

    2019.03   日本農芸化学会   Carbon-free production of 2-deoxy-scyllo-inosose (DOI) in cyanobacterium Synechococcus elongatus PCC 7942

    Satoru Watanabe, Hiroaki Ozawa, Hiroaki Kato, Kaori Nimura-Matsune, Toshifumi Hirayama, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi, Katsumi Kakinuma, Hirofumi Yoshikawa

     More details

    Award type:International academic award (Japan or overseas)  Country:Japan

  • JSBBA Award for Young Scientists

    2019.03  

     More details

    Award type:International academic award (Japan or overseas)  Country:Japan

  • 平成28年日本植物細胞分子生物学会、論文賞

    2016.09   日本植物細胞分子生物学会  

    Ishihara A, Ohishi K, Yamada T, Shibata-Hatta M, Arai-Kichise Y, Watanabe S, Yoshikawa H, and Wakasa K.

     More details

    Award type:International academic award (Japan or overseas)  Country:Japan

  • 第9日本ゲノム微生物学会年会ポスター賞(博士研究員以上の部)

    2015.03   第9回日本ゲノム微生物学会年会  

     More details

    Award type:International academic award (Japan or overseas)  Country:Japan

  • 2012年Biosci. Biotechnol. Biochem. 論文賞

    2013.03   日本農芸化学会  

    Kato H, Watanabe S, Nimura-Matsune K, Chibazakura T, Tozawa Y, Yoshikawa H.

     More details

    Award type:International academic award (Japan or overseas)  Country:Japan

Scientific Research Funds Acquisition Results 【 display / non-display

  • シアノバクテリアにおける巨大プラスミド維持機構の解明と大規模ベクター系の開発

    2020.04

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

    渡辺 智

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    細胞の増殖過程においてゲノムの複製は最も基本的な生命現象であるが、細胞辺り複数コピーのゲノムをもつ淡水性シアノバクテリアにおいて、ゲノムコピー数を規定するメカニズムや複製機構はよくわかっていない。本申請研究ではシアノバクテリアのゲノムコピー数の制御機構を解明すると共に、これに積極的に働きかけ、ゲノムコピー数の人為的な制御システムの構築を目指す。

  • シアノバクテリアを用いたストリゴラクトン高効率生産系構築と新規類縁体の創成

    2017.04 - 2019.03

    科学研究費補助金  新学術領域研究

    渡辺 智

      More details

    Authorship:Principal investigator 

  • 単細胞性真核紅藻における複製開始点の同定とそれを利用した人工染色体の構築

    2016.04 - 2019.03

    科学研究費補助金  基盤研究(C)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    近年、単細胞性の真核藻類は有用物質生産のホストとして期待が高まっている。中でも原始的な細胞構造、ゲノムを有し極限環境に生息する単細胞性真核紅藻Cyanidioschyzon merolae (以下シゾンと呼ぶ)は物質生産のホストとしても高いポテンシャルを秘めている。シゾンは遺伝子ターゲティングが可能な唯一の藻類であるが、遺伝子発現系を安定に保持させることが困難であり、現状では複雑な遺伝子改変は不可能である。今後、藻類工学を加速するためには藻類細胞において安定的に保持される新規ベクター系が必要である。出芽酵母では自律複製起点ARSと染色体の分配に必須であるセントロメアCENを用いた人工染色体が構築されベクターとして利用されている。シゾンにおいてもCENが明らかとなったため、シゾン複製開始点を同定し、これと合わせてシゾン人工染色体の構築を目指す。

  • シアノバクテリアのゲノムコピー数制御システムの構築

    2013.04 - 2016.03

    科学研究費補助金  若手研究(B)

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    細胞の増殖過程においてゲノムの複製は最も基本的な生命現象であるが、細胞辺り複数コピーのゲノムをもつ淡水性シアノバクテリアにおいて、ゲノムコピー数を規定するメカニズムや複製機構はよくわかっていない。本申請研究ではシアノバクテリアのゲノムコピー数の制御機構を解明すると共に、これに積極的に働きかけ、ゲノムコピー数の人為的な制御システムの構築を目指す。

Other External Funds 【 display / non-display

  • 原始紅藻シゾンにおけるヘム代謝経路の局在解析

    2009.04 - 2010.03

    民間財団等  21世紀COEプログラム 

      More details

    Authorship:Principal investigator  Grant type:Competitive

Past of Commissioned Research 【 display / non-display

  • アルカリバチルスとの相互作用による糸状性藍藻スピルリナの二次代謝活性化機構の解明

    2021.04 - 2023.03

    IFO 公益財団法人発酵研究所  一般受託研究  The General Consignment Study

    渡辺 智

  • 亜リン酸を用いたロバスト且つ封じ込めを可能とする微細藻類の培養技術開発

    2017.04

    広島大学大学院(先端物質科学研究科)  一般受託研究  The General Consignment Study

    廣田 隆一

      More details

    Authorship:Principal investigator 

Presentations 【 display / non-display

  • Cell division-uncoupled DNA replication and metabolism in cyanobacteria Synechococcus elongatus PCC 7942. International conference

    Satoru Watanabe

    15th International Symposium on Phototrophic Prokaryotes  2015.08 

     More details

    Event date: 2015.08

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:Tuebingen University  

    大腸菌や枯草菌等、バクテリアの細胞増殖はDNA複製と細胞分裂が密接に関連していることが知られている。本研究では細胞辺り複数コピーのゲノムを保持する淡水性シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942について、DNA複製と細胞分裂の頻度を各増殖相毎に比較した。その結果、Synechococcusのゲノムコピー数は誘導期に一過的に増加し、対数増殖期以後は減少することが明らかとなった。本研究成果により、Synechococcusの増殖制御は大腸菌、枯草菌とは大きく異なるということが示された。

  • Variety of dependency on DnaA protein for DNA replication among cyanobacterial lineages International conference

    Ryudo Ohbayashi, Satoru Watanabe, Shigeki Ehira, Yu Kanesaki, Taku Chibazakura, Hirofumi Yoshikawa

    15th International Symposium on Phototrophic Prokaryotes   2015.08 

     More details

    Event date: 2015.08

    Language:English   Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Tuebingen University  

    バクテリアの増殖においてDNA複製の開始はDnaAという複製開始因子によって制御される。複製の開始は細胞周期において最も重要な制御点であるためDnaAタンパク質はバクテリアにとって必須である。細胞辺り複数コピーのゲノムを持つ淡水性シアノバクテリアの3種においてDnaAの必須性について、解析を行った結果、2種では全く必須ではないのに対し、1種ではDnaAは必須であり、その欠損は内在性プラスミドによって相補されるということが明らかとなった。この結果は淡水性シアノバクテリアがDnaAに依存しない多様な複製開始制御機構を有するということを示唆している。

  • Identification of the associated genes for substrain-specific phenotypes of a cyanobacterium, Synechococcus elongatus PCC 7942 International conference

    Yu Kanesaki, Ryudo Obayashi, Satoru Watanabe, Hirofumi Yoshikawa

    15th International Symposium on Phototrophic Prokaryotes  2015.08 

     More details

    Event date: 2015.08

    Language:English   Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Tuebingen University  

    シアノバクテリアは光合成のモデル生物として世界中で広く用いられている一方で、各研究室の株(ラボストレイン)毎にゲノム情報とは異なる固有の変異を持つ事が知られていた。本研究では次世代シーケンサーを用いてシアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942のサブストレインのリシーケンス解析および表現型解析を実施した。個々のサブストレイン特有の一塩基多型や欠失領域を全ゲノムレベルで多数同定し、さらに熱耐性、運動性に関わる変異を明らかにした。

  • シアノバクテリアにおける増殖相に依存したゲノムコピー数制御機構

    渡辺智、大林龍胆、兼崎 友、齋藤菜摘、千葉櫻拓、曽我朋義、吉川博文

    第9回 ゲノム微生物学会年会  2015.03 

     More details

    Event date: 2015.03

    Language:Japanese   Presentation type:Poster presentation  

    細胞辺り複数コピーのゲノムを有する淡水性シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942の複製機構について概要を発表した。Synechococcuのゲノム複製起点、複製機構、各増殖相の特徴について概説した。

  • DNA Replication of Cyanobacterial Multi-Copy Chromosomes International conference

    Satoru Watanabe

    The German-Japanese Binational Seminar 2015 Harvesting Light:From light to biotechnological products  2015.03 

     More details

    Event date: 2015.03

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    細胞辺り複数コピーのゲノムを有する淡水性シアノバクテリアSynechococcus elongatus PCC 7942の複製機構について概要を発表した。Synechococcuのゲノム複製起点、複製機構、各増殖相の特徴について概説した。

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Teaching Experience 【 display / non-display

  • 微生物学

  • ゲノム生物学

  • 微生物科学

Committee Memberships 【 display / non-display

  • 日本分子生物学会   日本ゲノム微生物学会・会計幹事  

    2021.01   

      More details

    Committee type:Academic society

Attractiveness of Research 【 display / non-display

  • 研究ほど面白いことはない。学ぶことの喜びを共に分かち合おう!