Papers - FUJIMOTO Naoshi
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Hydrogen fermentation using lactate as the sole carbon source: Solution for ‘blind spots’ in biofuel production Reviewed
Akihiro Ohnishi , Yuji Hasegawa , Shinko Abe , Yukiko Bando , Naoshi Fujimoto and Masaharu Suzuki
RSC Advances: Royal Society of Chemistry 22 ( 2 ) 8332 - 8340 2012.07
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
バイオ燃料生産技術である水素発酵技術の盲点を整理し、これを解決する技術を提唱した。
DOI： 10.1039/C2RA20590D
Other Link： http://pubs.rsc.org/en/Content/ArticleLanding/2012/RA/c2ra20590d
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かび臭産生糸状藍藻類の遺伝子学的試験法の検討 Reviewed
矢野留実子、平健司、浅田安廣、藤本尚志、秋葉道宏
水道協会雑誌 91 ( 3 ) 2 - 12 2022.03
Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Biohydrogen production by mixed culture of Megasphaera elsdenii with lactic acid bacteria as Lactate-driven dark fermentation Reviewed
Akihiro Ohnishi , Yuji Hasegawa , Naoshi Fujimoto , Masaharu Suzuki
Bioresource Technology ( 343 ) 126076 2022.01
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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形態学的特徴と遺伝子解析に基づく全国水道水源でのカビ臭原因物質産生藍藻類の存在調査 Reviewed
江﨑敦、浅田安廣、藤本尚志、早坂泰彦、鈴木孝俊、山田晃平、秋葉道宏
水道協会雑誌 90 ( 5 ) 2 - 12 2021.05
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Characteristics of Tepidimicrobium xylanilyticum as a lactate-utilising bacterium in polylactic acid decomposition during thermophilic anaerobic digestion Reviewed
Hou-Chia Tseng, Naoshi Fujimoto, Akihiro Ohnishi
Bioresource Technology Reports 12 100596 2020.12
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Effects of elevated nitrogen on the growth and geosmin productivity of Dolichospermum smithii Reviewed
M, Lei Z, Zhang Z, Nishimura O, Asada Y, Fujimoto N, Takanashi H, Akiba M.
Environ Sci Pollut Res Int 28 ( 1 ) 177 - 184 2020.08
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Biodegradability and methane fermentability of polylactic acid by thermophilic methane fermentation Reviewed
Hou-Chia Tseng, Naoshi Fujimoto, Akihiro Ohnishi
Bioresource Technology Reports 8 100327 2019.12
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Community analysis of picocyanobacteria in an oligotrophic lake by cloning 16S rRNA gene and 16S rRNA gene amplicon sequencing Reviewed
Naoshi Fujimoto, Keigo Mizuno, Tomoki Yokoyama, Akihiro Ohnishi, Masaharu Suzuki, Satoru Watanabe, Kenji Komatsu, Yoichi Sakata, Naohiro Kishida, Michihiro Akiba, and Satoko Matsukura
J. Gen. Appl. Microbiol. 61 ( 5 ) 171 - 176 2015.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Evaluation of the Small-Eukaryote Community Composition in a Mesotrophic Lake by Sequencing the 18S rRNA Genes（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Eriko Matsuo, Masataka Murata, Kyohei Nomura, Akihiro Ohnishi, Masaharu Suzuki, Kazuya Enmoto, Shigeru Yamaguchi, Yasuo Yanagibashi, Naohiro Kishida, Michihiro Akiba
Japanese Journal of Water Treatment Biology 50 ( 2 ) 85 - 94 2014.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
18S rRNA遺伝子のクローニングにより草木湖の微小な真核生物(0.2–5µm)の生物相について検討を行った。主要な真核生物が明らかとなり、多くの未分類の系統の真核生物が存在することが示唆された。
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Study of the distribution of Megasphaera micronuciformis in oral cavities of the Japanese by species-specific polymerase chain reaction (PCR) assay Reviewed
Ran Murayama, Shinko Abe, Yuji Hasegawa, Taku Inoue, Kenji Tanaka, Yukiko Bando, Kazumasa Tonooka, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki and Akihiro Ohnishi*
African Journal of Microbiology Research 7 ( 79 ) 5546 - 5549 2013.12
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Megasphaera micronuciformis を特異的に検出するための技術を確立し、その有効性について考察した。
Other Link： http://www.academicjournals.org/journal/AJMR/article-abstract/8E90A4242117
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Analysis of Microbial Turbidity Increase in Water Purification Plant using 18S rRNA cloning and sequencing, jointly worked Reviewed
Naoshi FUJIMOTO, Masataka MURATA, Akihiro OHNISHI, Masaharu SUZUKI, Osamu YAJIMA, Naohiro KISHIDA, Michihiro AKIBA
Journal of Japan Water Works Association 82 ( 5 ) 2 - 10 2013.05
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
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可溶化処理を適用した二相式メタン発酵実証装置の研究―処理特性と微生物学的なメカニズムの解析―（共著） Reviewed
外ノ岡和政、海老澤拓哉、長野晃弘、大西章博、藤本尚志、鈴木昌治
環境技術 42 ( 4 ) 235 - 244 2013.04
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
可溶化処理と二相式メタン発酵法を組み合わせた小規模なメタン発酵システム（処理量100㎏/日）を開発した．厨芥や残飯など実廃棄物を用いて約７ヶ月間連続運転し，処理特性と微生物群集構造を評価した。
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A microbiological study of biohydrogen production from beer lees Reviewed
Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki, Akihiro Ohnishi
International Journal of Hydrogen Energy 38 ( 7 ) 2709 - 2718 2013.02
Authorship：Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： http://dx.doi.org/10.1016/j.ijhydene.2012.11.142
Other Link： http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0360319912026316
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A microbiological study of biohydrogen production from beer lees（共著） Reviewed
Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki, Akihiro Ohnishi
International Journal of Hydrogen Energy 38 ( 6 ) 2709 - 2718 2013.01
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ビール残渣を利用した水素発酵システムを開発を目的として、ビール残渣の水素発酵に関わる微生物群の探索を行った。さらに水素発酵菌の単離を行い、水素発酵能を評価した。
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Recent trends in microorganism-related off-flavor problems in drinking water treatment systems in Japan（共著） Reviewed
Naohiro Kishida, Yoshiaki Konno, Kentaro Nemoto, Taisuke Amitani, Akihito Maki, Naoshi Fujimoto, Michihiro Akiba
Water Science & Technology: Water Supply 13 ( 5 ) 1228 - 1235 2013
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
日本の142の浄水場に対してアンケート調査を実施し異臭味障害の現状を評価した。過去5年間に46の浄水場で異臭味障害が起こっており、その主な原因生物は藍藻類であった。
DOI： 10.2166/ws.2013.132
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Hydrogen fermentation using lactate as the sole carbon source: Solution for ‘blind spots’ in biofuel production（共著） Reviewed
Akihiro Ohnishi, Yuji Hasegawa, Shinko Abe, Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzukia
RSC Advances 2 8332 - 8340 2012.07
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Megasphaera elsdeniiによる酪酸を炭素源とする水素発酵について初めて報告した。
DOI： 10.1039/C2RA20590D
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Rapid detection and quantification methodology for genus Megasphaera as a hydrogen producer in a hydrogen fermentation system（共著） Reviewed
Akihiro Ohnishi, Shinko Abe, Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
International Journal of Hydrogen Energy 37 ( 3 ) 2239 - 2247 2012.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
PCR-RFLP法やFISH法を用いて水素発酵システム内における水素生産菌であるMegasphaera属の検出および定量を行った。
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Rapid detection and quantification methodology for genus Megasphaera as a hydrogen producer in a hydrogen fermentation system Reviewed
Shinko Abe, Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
International Journal of Hydrogen Energy 37 2239 - 2247 2012.01
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： 10.1016/j.ijhydene.2011.10.094
Other Link： http://www.elsevier.com/wps/find/journaldescription.cws_home/485/authorinstructions
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Development of a 16S rRNA gene primer and PCR-restriction fragment length polymorphism method for rapid detection of members of the genus Megasphaera and species-level identification（共著） Reviewed
Akihiro Ohnishi, Shinko Abe, Shiho Nashirozawa, Sayaka Shimada, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
Applied and Environmental Microbiology 77 ( 15 ) 5533 - 5535 2011.08
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Megasphaera属を種レベルで検出する16S rRNAプライマーセットおよびRFLP法を開発した。
DOI： 10.1128/AEM.00359-11
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Development of a 16S rRNA gene primer and PCR-restriction fragment length polymorphism method for rapid detection of members of the genus Megasphaera and species-level identification Reviewed
Akihiro Ohnishi, Shinko Abe, Shiho Nashirozawa, Sayaka Shimada, Naoshi Fujimoto, and Masaharu Suzuki
Applied and Environmental Microbiology 2011.08
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
嫌気性微生物Megasphaera属5菌種の重要性について言及し、これらの迅速かつ簡便な検出と種レベルの識別を行うための技術論として、Megasphaera属に特異的なPCR－RFLP法を開発した。本技術論は当該微生物の全球的な広がりと役割の理解に役立つ。
DOI： 10.1128/AEM.00359-11
Other Link： http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/AEM.00359-11v1?etoc
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Phylogenetic and physiological characterization of mesophilic and thermophilic bacteria from a sewage sludge composting process in Sapporo, Japan（共著） Reviewed
Akihiro Ohnishi, Akihiro Nagano, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
World Journal of Microbiology and Biotechnology 27 333 - 340 2011
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
下水汚泥コンポストから分離した中温細菌および高温細菌について分子系統学的解析および生理学的な解析を行った。
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Phylogenetic and physiological characterization of mesophilic and thermophilic bacteria from a sewage sludge composting process in Sapporo, Japan Reviewed
Akihiro Ohnishi, Akihiro Nagano, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
World Journal of Microbiology and Biotechnology 27 333 - 340 2011
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
札幌市における高速堆肥化施設の微生物相を解析し、新規性の高い複数の微生物群が存在することを明らかにした。新規の微生物群NoID.Aは有機物分解能が高く、堆肥化過程で重要な役割を担う可能性が考えられた。
DOI： 10.1007/s11274-010-0463-y
Other Link： http://www.springerlink.com/content/g5245046365603k8/
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Development of a simple bio-hydrogen production system through dark fermentation by using unique microflora Reviewed
Akihiro Ohnishi, Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto and Masaharu Suzuki
International Journal of Hydrogen Energy 35 ( 16 ) 8544 - 8553 2010.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ユニークな微生物群を用いた暗黒水素生産システムを開発した。有機性廃棄物から簡便にバイオ水素を生産可能であった。本論文はMegasphaera属菌種がバイオ水素生産の主役と成り得ることを示した第一報である。
DOI： 10.1016/j.ijhydene.2010.05.113
Other Link： http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0360319910010839
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Development of a simple bio-hydrogen production system through dark fermentation by using unigue microflora（共著） Reviewed
Akihiro Ohnishi, Yukiko Bando, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
International Journal of Hydrogen Energy 35 8544 - 8553 2010.05
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Megasphaera elsdeniiおよびLactbacillus等から構成される従来とは異なる微生物群による効率的な水素発酵システムを確立した。
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Influence of Anabaena Akinete on Algal-Bloom in Dam Reservoir Reviewed
Mikitaka Tsuchida, Munehiro Nomura, Shuhei Masuda, Nobuo Chiba, Naoshi Fujimoto, Kazunori Nakano, Osamu Nishimura
Environmental Engineering Research 46 75 - 79 2009.11
Language：Japanese Publishing type：Research paper (other academic)
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漆沢ダム湖等の湖沼、貯水池から分離した藍藻類Anabaena属の形態による分類および分子系統解析（共著） Reviewed
藤本尚志、佐藤祐吾、大国真隆、阿曾忍、大西章博、鈴木昌治、野村宗弘、西村修
水環境学会誌 32 ( 9 ) 501 - 504 2009.09
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
漆沢ダム湖等の湖沼、貯水池から分離した分離したAnabaena属の系統解析を行ったところ、16S rDNAでは四つ，rbcLXでは五つのクラスターに分かれることが明らかとなった。16S rDNAの系統樹において螺旋を巻く種と直線的なトリコームを形成する種が同一のクラスターに混在することが明らかとなった。系統解析の結果，分離したほとんどの株は有毒株とは異なるクラスターに位置することが明らかとなった。
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藍藻類Microcystis aeruginosaおよびPlanktothrix agardhiiを混合した懸濁液における原生動物鞭毛虫類Monas guttulaの増殖特性（共著） Reviewed
藤本尚志、村上達矢、大西章博、鈴木昌治、岩見徳雄
日本水処理生物学会誌 45 ( 3 ) 137 - 142 2009.09
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
糸状性藍藻類Planktothrix agardhiiが存在することにより、原生動物Monas guttulaの比増殖速度、最大増殖量が高まることが明らかとなった。P. agardhii濃度2.5mg・l-1以上においてM. guttulaの比増殖速度が高まることが明らかとなった。P. agardhiiが存在することによりM. guttulaによるM. aeruginosaの捕食速度が高まることが明らかとなり、比増殖速度が高まる要因と考えられた。
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複合微生物系による生ごみの水素発酵に関する研究（共著） Reviewed
黄笑宇、大西章博、登坂充博、藤本尚志、鈴木昌治
環境技術 37 ( 6 ) 421 - 427 2008.06
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
本研究では、生ごみの水素発酵システムにおける微生物学的な安定化技術を確立するための基礎的知見を得ることを目的とした。Clostridium属菌種単独による生ごみからの水素発酵における問題点について解析するとともに、系統群の異なる複数の菌種を混合することで生ごみからの水素発酵能の安定化を試みた。
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Growth promotion of the flagellate protozoan Monas guttula by the addition of granular media and glass beads（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Yuta Sakuuchi, Akihiro Ohnishi, Masaharu Suzuki, Norio Iwami
Japanese Journal of Water Treatment Biology 44 ( 1 ) 49 - 55 2008.03
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
セラミックス担体、ガラスビーズの存在により原生動物Monas guttulaの比増殖速度、最大増殖量が高まり、藍藻類Microcystis viridisの減少が速まることが明らかとなった。担体は固着性の原生動物を高密度に保持する上で有用と考えられていたが、M. guttulaのような遊泳性の性質を有する原生動物の増殖を促進する効果があることが示唆された。
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生ごみの固体発酵法によるバイオエタノール製造技術の開発（共著） Reviewed
本多宏明、大西章博、藤本尚志、鈴木昌治
環境技術 37 ( 3 ) 207 - 215 2008.03
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
従来よりバイオエタノールの製造には液体発酵法が広く採用されている。本法はエタノールを蒸留した後に発生する蒸留廃液の処理が大きな問題となっている。この蒸留廃液の排出を極力抑制することを可能にする新規の発酵法としてエタノール固体発酵システムを考案した。
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漆沢ダム貯水池におけるアオコ発生制御効果の検討（共著） Reviewed
野村宗弘、佐藤博信、設楽和彦、坪根史佳、千葉信男、藤本尚志、中野和典、西村修
環境工学研究論文集 44 525 - 530 2007.11
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
人為的汚濁負荷のない漆沢ダム貯水池において水質構造を把握するために現地観測を行うとともに鉛直一次元の水質予測モデルを構築し、アオコ発生の制御効果について検討した。河川水のダム同密度層への流入ならびに取水の影響をモデルに組み込むことにより、二段階の成層の状況ならびにChl. aの変動といった貯水池内の水質構造を概ね再現することができた。
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水素発酵微生物群の集積と菌相解析（共著） Reviewed
黄笑宇、松本明子、大西章博、坂本勝、藤本尚志、鈴木昌治
環境技術 36 ( 7 ) 501 - 508 2007.07
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
本研究では生ごみを発酵基質として安定的に水素を生産する微生物群の探索を試みた。下水汚泥コンポスト中の微生物群を用いることで安定した生ごみの水素発酵が可能であることが確認された。
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Degradation of the cyanobacterial hepatotoxin microcystin by bacteria isolated from a monoxenic culture of the flagellate Monas guttula（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Akihiro Ohnishi, Masaharu Suzuki, Norio Iwami, Motoyuki Mizuochi, Yuhei Inamori
Japanese Journal of Water Treatment Biology 43 ( 2 ) 99 - 111 2007.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
原生動物Monas guttulaの培養液からミクロシスチン分解菌MG-15、MG-22株を分離した。これらの細菌は16S rDNAを解析したところ、Sphingopyxis属、Novosphingomonas属に近縁であることが明らかとなった。さらにミクロシスチンの分解に及ぼす温度、pH、初期ミクロシスチン濃度の影響について検討を行った。
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漆沢ダム湖におけるアオコ発生に係わる水質構造特性（共著） Reviewed
設楽和彦、野村宗弘、千葉信男、藤本尚志、中野和典、西村修
環境工学研究論文集 42 487 - 493 2005.12
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
2004年に人為的汚濁負荷源のない貯水池である宮城県漆沢ダム湖の調査を行った。Chl. a濃度は8月に最大300ug/Lとなり優占種はAnabaena属であった。水温躍層が生じたときにリンが表層に蓄積し、それによりアオコの発生が起こっていると考えられた。
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Mycelia sterilia M1株の廃糖蜜脱色過程における糖蜜色素とポリフェノール類の消長（共著） Reviewed
波多野和樹、大西章博、藤本尚志、中西載慶、鈴木昌治
日本食品保蔵科学会誌 31 ( 6 ) 309 - 313 2005.11
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
Mycelia sterilia M1株の廃糖蜜脱色過程における糖蜜色素とポリフェノール類の消長をゲルクロマトグラフィーにより調べた。その結果、糖蜜色素とポリフェノール類のゲルクロマトグラムのピークはよく一致し、両者とも分子量11800以上の高分子画分と5900以下の低分子画分に主要ピークが確認された。
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藍藻類Cylindrospermopsis raciborskiiの回分培養における肝臓毒cylindrospermopsin産生特性（共著） Reviewed
藤本尚志、今野紗綾香、吉野由貴、大西章博、鈴木昌治、水落元之、稲森悠平
日本水処理生物学会誌 41 ( 3 ) 153 - 158 2005.09
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
藍藻類Cylindrospermopsis raciborskiiを窒素が豊富な条件ならびに窒素制限の条件において回分培養を行い、窒素固定ならびに肝臓毒cylindrospermopsin(CYN)産生特性について検討を行った。初期NO3-N濃度が低い条件下において、窒素固定により増殖し、それにともないCYN濃度が増加した。全CYN濃度と全窒素濃度との間に正の相関が見られ、窒素固定量が増加するにつれて、CYN濃度が高まることが明らかとなった。
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かび臭産生藍藻類Phormidium tenueを溶解する細菌の分離と溶藻特性に関する研究（共著） Reviewed
押見誠則、藤本尚志、大西章博、鈴木昌治、秋葉道宏、国包章一
水環境学会誌 28 ( 6 ) 379 - 384 2005.06
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
水道水のかび臭の原因となる藍藻類Phormidium tenueに対して溶藻効果を示す細菌を分離し，その溶藻特性について検討を行った。分離した溶藻細菌のうち，Pseudomonas KA6株は細胞外に溶藻物質を産生し，P. tenueを速やかに溶解した。KA6株の培養液のろ過液を添加してP. tenueを培養したところ，5 %以上の添加において増殖を抑制した。ろ過液は25-35℃，pH 7-9の条件で効率的にP. tenueを溶解した。
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Mycelia sterilia M1株による廃糖蜜の脱色と副生多糖の諸性質（共著） Reviewed
波多野和樹, 大西章博, 藤本尚志, 鈴木昌治, 中西載慶
日本食品保蔵科学会誌 30 ( 5 ) 235 - 241 2004.09
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
Mycelia sterilia M1株の廃糖蜜に対する脱色活性と粘質物生産に適した培養条件について検討した。グルコースの添加や,廃糖蜜中のスクロースを塩酸により加水分解することにより脱色性および粘質物生産性が促進された。粘質物を回収した後の残液の脱色率は77.4%を示し,またスクロースの残存量が多く,91%の残存率を示した。また,得られた粘質物は六炭糖を主要構成糖とする多糖類であった。
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培養法と分子生物学的手法を用いたコンポスト化初期における細菌相の解析（共著） Reviewed
大西章博、長野晃弘、藤本尚志、牛久保明邦、大澤貫寿、鈴木昌治
環境技術 33 ( 8 ) 620 - 630 2004.08
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
培養法と分子生物学的手法(FISH法,PCR-DGGE法)により,厨芥のコンポスト化過程における細菌相の解析を試みた。発酵初期の高温環境下において有機物分解の主役を担うことが考えられる細菌群として好熱性細菌のGeobacillus thermodenitrificansとGeobacillus toebiiを特定した。FISH法による解析の結果から,コンポスト化初期の高温環境下ではグラム陽性低GC含量グループの細菌群が優占しているものと考えられた。
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FISH(fluorescence in situ hybridization)法を適用したコンポスト好熱性細菌の検出技術の開発（共著） Reviewed
大西章博、長野晃弘、藤本尚志、高橋力也、牛久保明邦、鈴木昌治
環境技術 32 ( 12 ) 976 - 985 2003.12
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
厨芥のコンポスト化過程における菌相解析と代表的菌株の同定を行った。常に検出されたグループは,好熱性Bacillus属のB.licheniformisであることが示された。FISH法によりBacillus属を直接検出するための条件を検討した結果,lysozymeによる細胞壁処理を行うことによってFISH Probeが細胞内に透過し,明確な検出が可能になった。来雑物からの自家蛍光や多数の細菌細胞の中からB.licheniformisを直接検出することが可能であった。
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Comparison of effects of temperature on the growth of protozoa and metazoan in Thailand and Japan（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Norio Hayashi, Takahiro Ouchiyama, Motoyuki Mizuochi and Yuhei Inamori
Japanese Journal of Water Treatment Biology 39 ( 2 ) 93 - 97 2003.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
タイ王国の排水処理施設等から採取した原生動物及び後生動物の増殖に及ぼす温度の影響を検討した。これらは15℃以下の低水温では増殖できないことが明らかとなった。増殖の温度に対する依存性の指標となる活性化エネルギーは日本産に比較してタイ王国産の方が大きく,温度の影響を受けやすいことが明らかとなった。
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Environmental conditions associating microcystins production to Microcystis aeruginosa in a reservoir of Thailand（共著） Reviewed
X. Wang, P. Parkpian, N. Fujimoto, K. M. Ruchirawat, R. D. DeLaune and A. Jugsujinda
Journal of Environmental Science and Health 37 ( 7 ) 1181 - 1207 2002.07
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
タイ王国の貯水池において藍藻類Microcystis aeruginosaが産生する有毒物質ミクロシスチンの発生と窒素、リン濃度、水温、光強度等の環境因子との関係について検討を行った。
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鉄電解法を導入した嫌気ろ床・生物ろ過法における負荷変動が処理性能に及ぼす影響評価（共著） Reviewed
山本泰弘, 森泉雅貴, 井上充, 藤本尚志,稲森悠平,松村正利
Eco-Engineering 14 ( 2 ) 19 - 25 2002.04
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
鉄電解法を導入した嫌気ろ床・生物ろ過法による小規模生活廃水の窒素・りん同時除去システムを用い,活性汚泥への水量負荷(l/日)と循環比の影響を評価した。窒素・りん同時除去のための最適循環比は2.8-4.0と2.8(同順に水量負荷1000と2000の時)で,この時のBODとT-NとT-PとSSは同順に≦10と≦1と≦10と≦10(各mg/l)を得た。
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嫌気ろ床・生物ろ過法における物理化学的りん除去法導入による処理性能の評価（共著） Reviewed
山本泰弘, 三浦勇二, 井上充 , 藤本尚志,稲森悠平,松村正利
日本水処理生物学会誌 38 ( 1 ) 47 - 55 2002.03
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
小規模生活排水からの窒素・りん除去技術の開発を目的として,嫌気ろ床・生物ろ過法に凝集沈殿法及び鉄及びアルミニウム電解法等の物理化学的りん除去法を組み込んだ場合における有機物,窒素,りん除去特性および発生汚泥について検討した。嫌気ろ床・生物ろ過法に物理化学的りん除去法を導入することにより,りん除去性能と有機物除去性能が向上することが明らかになった。
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Production of Cyanobacterial Hepatotoxin Microcystin in a nutrient-limited Culture of Microcystis viridis（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Masatoshi Soma, Maiko Yoshida, Masaharu Suzuki, Rikiya Takahashi, Yuhei Inamori
Japanese Journal of Water treatment Biology 38 ( 1 ) 39 - 45 2002.01
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
藍藻類Microcystis viridisのmicrocystinの産生特性について解析を行った。窒素枯渇細胞に対して窒素を加えた場合と、リン枯渇細胞にリンを加えた場合を比較すると、窒素枯渇細胞に窒素を加えたほうが比産生速度が高いことが明らかとなった。窒素が枯渇した細胞に対し硝酸性窒素を添加したところ、microcystinが増殖に先立って産生されることが明らかとなった。
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Effect of metazoa on proportion of physiologically active bacteria（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Asuka Iida, Masaharu Suzuki, Rikiya Takahashi, Yuhei Inamori
Japanese Journal of Water Treatment Biology 35 ( 4 ) 279 - 284 1999.12
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
後生動物輪虫類Philodina erythrophthalmaが存在しない系とP.eryt hrophthalmaが存在する系において蛍光染色法により全細菌数、生理活性を有する細菌数を求めた。P.erythro phthalmaが存在すると、全細菌数は明らかに減少するが生理活性を有する細菌数の減少の割合が小さく、結果として生存率が6%増加することが明らかとなった。
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原生動物縁毛類の増殖に及ぼす環境因子の影響（共著） Reviewed
林紀男、大内山高広、藤本尚志、稲森悠平
日本水処理生物学会誌 35 ( 4 ) 271 - 278 1999.12
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
活性汚泥法や生物膜法において浄化に貢献する原生動物縁毛類Vorticella属の増殖に及ぼす温度、塩濃度、細菌の種類、細菌濃度、pH、撹拌強度といった環境因子の影響について評価を行った。
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Lactobacillus casei SM3株の糖蜜アルコール蒸留廃液脱色特性（共著） Reviewed
鈴木昌治、谷垣元揮、長野晃弘、藤本尚志、高橋力也
日本醸造協会誌 94 ( 10 ) 833 - 839 1999.10
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
糖蜜アルコール蒸留廃液のLactobacillus casei SM3による最適脱色反応条件と脱色特性を評価した。0.5%のグルコースを含む色度12000の蒸留廃液中の糖蜜色素を30度、24時間の半嫌気培養により約30%脱色した。この脱色は糖蜜色素分子の高分子量領域（分子量として10000以上の区分）に分布している色素物質に対する脱色反応に基づくものであった。一方、低分子領域に分布している色素物質はほとんど脱色されなかった。
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生物処理反応槽に出現する微小動物の増殖・定着に及ぼす担体の効果（共著） Reviewed
藤本尚志、末長巨行、鈴木昌治、高橋力也、藤井邦彦、稲森悠平
日本水処理生物学会誌 35 ( 3 ) 157 - 163 1999.09
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
生物処理施設において汚泥の減量化、処理水の透明化に貢献する原生動物、後生動物を対象として中空小円筒状担体への付着特性と増殖に及ぼす影響について検討をおこなった。担体の添加により縁毛類で約9倍、輪虫類で約2.5倍の生息密度が得られることが明らかとなった。担体の添加は、生物処理施設に微小動物を高密度に安定して定着させる上で極めて有効であると考えられた。
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N:P比をパラメータとした連続混合培養系における藍藻類の種間競争の数理モデルによる解析（共著） Reviewed
藤本尚志、鈴木昌治、高橋力也、杉浦則夫、稲森悠平、須藤隆一
水環境学会誌 22 ( 9 ) 749 - 754 1999.09
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
藍藻類Microcystis aeruginosaとPhormidium tenueの連続培養系における動態を数理モデルにより再現し、このN:P比の違いによる２種の藍藻類間の種の変遷に窒素の増殖に関わる定数等が関与していることを明らかにした。
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Production of (S,S)-Ethylenediamine-N,N'-disuccinic Acid from Ethylenediamine and Fumaric Acid by Bacteria（共著） Reviewed
Rikiya Takahashi, Kenji Yamayoshi, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki
Biosci. Biotech. Biochem. 63 ( 7 ) 1269 - 1373 1999.07
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
エチレンジアミンとフマル酸の混合液に土壌や汚泥から分離した細菌を接種し、EDDSの生成について検討を行ったところ、Sphingomonas属、Pseudomonas属、Brevundimonas属、Acidovorax属の細菌においてEDDSの生成が見られた。さらにAcidovorax属の至適温度、至適pH、EDDSの収率について検討を行った。
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乳酸菌保存株の糖蜜アルコール蒸留廃液脱色能（共著） Reviewed
鈴木昌治、廉澤ひろみ、長野晃弘、藤本尚志、高橋力也
日本醸造協会誌 94 ( 5 ) 420 - 424 1999.05
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
乳酸菌保存株の糖蜜アルコール蒸留廃液に対する脱色能を調べたところ、脱色活性の強い菌株はLactobacillus属の菌種に限定されて存在した。Lactobacillus属の菌種の中でもLacto. caseiグループの菌種は共通して脱色活性が強く、その脱色反応は蒸留廃液中の糖蜜色素分子の高分子側色素を特異的に脱色する細胞膜区分の酵素に基づく反応であった。
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FISH (fluorescent in-situ hybridization)法によるBacillus stearot hermophilus IAM 11062の検出（共著） Reviewed
鈴木昌治、谷垣元揮、長野晃弘、荒木信夫、藤本尚志、高橋力也
東京農業大学農学集報 44 ( 3 ) 182 - 190 1999.01
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (bulletin of university, research institution)
コンポスト中の代表的な高温性細菌Bacillus stearothe rmophilus IAM11062を特異的に検出するための合成オリゴヌクレオチドDNAプローブを設計し、蛍光標識を付加したプローブを合成した。塩酸により菌体を処理することにより高温性グラム陽性菌の研究が可能となることが示唆された。本プローブによりB. stearothermophilus IAM11062と遺伝的に近縁な高温性細菌を種レベルで識別できることが示唆された。
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糖蜜アルコール蒸留廃液脱色能を有する乳酸菌の検索と同定（共著） Reviewed
鈴木昌治、廉澤ひろみ、長野晃弘、藤本尚志、高橋力也
日本醸造協会誌 93 ( 12 ) 982 - 989 1998.12
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
糖蜜アルコール蒸留廃液に対して高い脱色能を有する乳酸菌を検索・分離し、Lactobacillus caseiと同定した。脱色活性は無細胞抽出液と細胞膜区分に存在する酵素に認められた。本菌による蒸留廃液の脱色は糖蜜色素分子の高分子側区分を脱色する細胞膜区分の特異的な酵素に基づく反応であることが明らかとなった。
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Biodegradabilities of Ethylened iamine-N,N'-disuccinic Acid (EDDS) and other Chelating Agents（共著） Reviewed
Rikiya Takahashi, Naoshi Fujimoto, Masaharu Suzuki, Takakazu Endo
Biosci. Biotech. Biochem. 61 ( 11 ) 1957 - 1959 1997.11
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
EDDSおよびその他のキレート剤について生分解性を検討したところ、EDTAは分解性が低く、NTAおよびPDDSは活性汚泥の馴養後分解されることがわかった。さらに、EDDSについてはRS体とSS体は分解されやすいが、RR体は分解性が低く、SS体は馴養なしでも分解されることがわかった。
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Nutrient-limited growth of Microcystis aeruginosa and Phormidium tenue and competition under various N:P supply ratios and temperatures（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Ryuichi Sudo, Norio Sugiura, Yuhei Inamori
Limnology and Oceanography 42 ( 2 ) 250 - 256 1997.03
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
藍藻類Microcystis aeruginosaとPhormidium tenueをケモスタットを用いて連続純粋培養ならびに連続混合培養したところ、M. aeruginosaが高温適応性であること、P. tenueの窒素要求性が高いこと、混合培養実験においてN/P比が低い条件ではM. aeruginosaがN/P比が高い条件下ではP. tenueが優占すること等を明らかにした。
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全国湖沼データの解析による藍藻類の優占化と環境因子との関係（共著） Reviewed
藤本尚志、福島武彦、稲森悠平、須藤隆一
水環境学会誌 18 ( 11 ) 901 - 908 1995.11
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
全国湖沼データを解析し、藍藻類の優占化と環境因子との関係について検討を行い、富栄養化した湖沼ではN/P比の増加とともに藍藻類の優占率が増加すること、水温が高い湖沼において藍藻類、特にMicrocystis属の優占率が高まること、混合の強い湖沼ほど藍藻類、とくにOscillatoria属,Phormidium属といった糸状性藍藻類の優占率が高まること等を明らかにし、これらの環境因子と藍藻類の優占化との間に密接な関係があることを明らかにした。
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藍藻類の混合培養系に及ぼす温度の影響（共著）
藤本尚志、杉浦則夫、西村修、稲森悠平、須藤隆一
日本水処理生物学会誌 30 ( 1 ) 45 - 48 1994.06
Authorship：Lead author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
アオコを形成する代表的な藍藻類Microcystis aeruginosaおよびAnabaena spiroidesを様々な温度において混合培養し、この２種の藻類の個体数が定常状態に達した後、温度変化を与えたところM. aeruginosaはその個体数を維持したが、A.spiroidesの個体数は著しく低下し、初夏におけるAnabaena属からMicrocystis属への優占種の変化の要因として水温の上昇が重要であることを明らかにした。
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Effect of temperature change on algal growth（共著） Reviewed
Naoshi Fujimoto, Yuhei Inamori, Norio Sugiura, Ryuichi Sudo
Environmental Technology 15 497 - 500 1994.05
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
生産者としての藍藻類Microcystis viridis、緑藻類Selenastrum capricornutumについて温度に対する馴化性を実験的に検討し、この２種の藻類はともに、温度の上昇に対して速やかに馴化したが、S. capricornutumはM. viridisに比較して温度の低下に対する馴化が遅いことを明らかにした。