Papers - TAMURA TOMOKO
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Acute ultraviolet B irradiation increases cholesterol and decreases Cyp7a1 expression in the liver of female mice Reviewed International journal
Takumi Yamane, Takahiro Okumoto, Tomoko Tamura, Yuichi Oishi
Lipids 2024.07
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Recent studies have demonstrated that ultraviolet B (UVB) irradiation impacts both skin and hepatic functions. In this study, we investigated the effects of UVB irradiation on cholesterol metabolism in the liver. Hairless mice were exposed to UVB (1.6 J/cm2) irradiation. Dorsal skin and liver samples were collected 24 h after exposure. Total RNA was extracted from the skin and liver tissues, and used for DNA microarray analysis and real-time polymerase chain reaction (PCR). Hepatic mRNA expression of Cyp7a1 revealed a 4.4-fold decrease in the UVB (+) group compared to that in the UVB (-) group. No differences were observed in the expression of the other genes related to cholesterol metabolism. Additionally, the level of hepatic total cholesterol in the UVB (+) group was significantly higher than in the UVB (-) group. These findings suggest that acute UVB irradiation increases total cholesterol levels and decreases Cyp7a1 expression in the liver.
DOI： 10.1002/lipd.12407
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Genes related to cell wall metabolisms are targeted by miRNAs in immature tomato fruits under drought stress Reviewed International journal
Hiroko Asakura, Mayui Tanaka, Tomoko Tamura, Yoshikazu Saito, Takashi Yamakawa, Keiko Abe, Tomiko Asakura
87 ( 3 ) 290 - 302 2022.12
Language：English
The metabolism of tomato fruits changes when plants experience drought stress. In this study, we investigated changes in microRNA (miRNA) abundance and detected 32 miRNAs whose expression changes in fruit. The candidate target genes for each miRNA were predicted from the differentially expressed genes identified by transcriptome analysis at the same fruit maturation stage. The predicted targeted genes were related to cell wall metabolisms, response to pathogens, and plant hormones. Among these, we focused on cell wall metabolism-related genes and performed a dual luciferase assay to assess the targeting of their mRNAs by their predicted miRNA. As a result, sly-miR10532 and sly-miR7981e suppress the expression of mRNAs of galacturonosyltransferase-10 like encoding the main enzyme of pectin biosynthesis, while sly-miR171b-5p targets β-1,3-glucosidase mRNAs involved in glucan degradation. These results will allow the systematic characterization of miRNA and their target genes in the tomato fruit under drought stress conditions.
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Transcriptomic and Metabolomic Analyses Provide Insights into the Upregulation of Fatty Acid and Phospholipid Metabolism in Tomato Fruit under Drought Stress Reviewed
Hiroko Asakura, Takashi Yamakawa, Tomoko Tamura, Reiko Ueda, Shu Taira, Yoshikazu Saito, Keiko Abe, and Tomiko Asakura
J. Agric. Food Chem 69 ( 9 ) 2894 - 2905 2021.02
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Yeast‐based reporter assay system for identifying the requirements of intramembrane proteolysis by signal peptide peptidase of Arabidopsis thaliana Reviewed
Kenta Kusunoki Masako Hoshi Tomoko Tamura Tatsuya Maeda Keiko Abe Tomiko Asakura
FEBS Openbio 10 1833 - 1842 2020.07
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Oryza sativa Brittle Culm 1-like 6 modulates β-glucan levels in the endosperm cell wall Reviewed
Keiko Midorikawa, Masaharu Kuroda, Haruyuki Yamashita, Tomoko Tamura, Keiko Abe, and Tomiko Asakura
PLOS ONE 14 2019
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Gene expression profiling in short-term imbibition of wheat: tools for dissecting of pasting properties of imbibed wheat Seeds. Reviewed
Tomoko Tamura, Sayuri Akuzawa and Kiyoshi Mura
Journal of Food Science 84 2019
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Draft genome sequence of Zygosaccharomyces mellis CA-7, isolated from honey Reviewed
Yuh Shiwa, Yu Kanesaki, Taichiro Ishige, Kiyoshi Mura, Taichi Hori, and Tomoko Tamura
Microbiology Resource Announcements 8 2019
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： 10.1128/MRA.00449-19
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Bacillus cereusBacillus cereus Response to a Proanthocyanidin Trimer, a Transcriptional and Functional Analysis Reviewed
Tomoko Tamura, Megumi Ozawa,Naoto Tanaka, Soichi Arai, Kiyoshi Mura
Current Microbiology 73 115 - 123 2016.07
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
食中毒細菌に対するラッカセイ種皮ポリフェノールの抗菌活性を遺伝子の発現変動を調べることで検討した。
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Comparison of the antioxidant activities between the proanthocyanidin of a different degree of polymerization from peanut skin Reviewed
Ryushi Ebisawa, Tomoko Tamura1, Megumi Ozawa, Kiyoshi Mura 1：corresponding author
Food Preservation Science 41 ( 1 ) 2015.02
Authorship：Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Inhibitory Effect of Oligomeric Poacclyphenols from Peanut-Skin on Sugar Digestion Enzyme and Glucose Transport Reviewed
Tomoko TAMURA, Megumi OZAWA, Shoko KOBAYASHI, Hirohito WATANABE, Soichi ARAI, Kiyoshi MURA
Food Science and Technology Research 21 ( 1 ) 111 - 115 2015.01
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Characterizing the Quality of Imbibed Soybean at an Early Stage of Pregermination for Development of a New Protein Food Item Reviewed
Tomoko TAMURA, Asuka KAMEI, Reiko UEDA, Soichi ARAI, and Kiyoshi MURA
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2014.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
大豆の休眠打破および吸水発芽の生理を、DNAマイクロアレイ解析により遺伝子発現プロファイリングを得ることで追及した。吸水後0 hから8 hにおいても8 hから16 hにおいても発現上昇した遺伝子は、ジベレリン応答遺伝子や細胞伸長に関わる遺伝子などであった。また、吸水後8hから16hのみで発現上昇した遺伝子は糖、各種アミノ酸、脂肪酸の生合成と代謝に関わる遺伝子であった。一方、吸水により発現が減少した遺伝子は、リポキシゲナーゼ、オレオシン、グルコシル基転移酵素などであった。発芽の生理は研究例があるが、吸水初期とくに幼根が種皮を突き破るいわゆる“発芽”までの代謝は研究例が少なく、休眠打破しない種子は安定した食物生産を考慮した際に大きな問題点であるため着目した。
一方、種子は吸水により糖質・タンパク質・脂質等の代謝がドラスティックに変動し、その結果、食味の変化、呈味アミノ酸の増加、GABAや各種ビタミン、オリゴ糖などが増加し、食品機能性が向上することが知られている。ダイズを加工する際日本では大豆を浸漬させ豆腐・豆乳・納豆などの加工食品を作るが、今回浸漬時間と加工特性を変化させる成分の変動を調べた。GABA量は、吸水前は16.3 mg/100 g (穀物)であったが、吸水16 hまでに2.2倍になり、その後急激に増加し吸水48 hで7倍になった。ビタミンCは吸水とともに徐々に増加し、48 h後に3.7倍の5.5 mg/100 g (穀物)になった。また、豆腐製造には大豆タンパク質の凝固が必要であるが、グリシニン・コングリシニンともに吸水時間による凝固特性の変化はなく、加工特性を変化させることは無かった。 -
Peanut-skin polyphenols, procyanidin A1 and epicatechin-(4β→6)-epicatechin-(2β→O→7, 4β→8)-catechin, exert cholesterol micelle-degrading activity in vitro Reviewed
Tomoko Tamura, Naoko Inoue, Megumi Ozawa, Akiko Shimizu-Ibuka, Soichi arai, Naoki Abe, Hiroyuki Koshino, and Kiyoshi Mura
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 77 1036 - 1039 2013.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ラッカセイ種皮ポリフェノールから、3量体プロアントシアニジンを新たに同定し、1量体・2量体ポリフェノールとともにコレステロールのミセル不溶化能を試験した。重合度の高い3量体ポリフェノールの方が2量体やカテキン単体よりもミセル不溶化能を強く有していた。
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Novel angiotensin I-ｃonverting enzyme inhibitory peptides found in a thermolysin-treated elastin with antihypertensive activity Reviewed
Yuko Sato, Tsudoi Toyoda, Akiko Shimizu-Ibuka, Tomoko Tamura, Kazuo Kobayashi-Hattori, Takemichi Nakamura Soichi Arai, and Kiyoshi Mura
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 76 1329 - 1333 2012.07
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
サーモリシンを用いてエラスチンおよびコラーゲンを分解したところ、ACE阻害活性を有する数種類のペプチドを単離することに成功した。また、高血圧自然発症ラットにペプチド含有食餌を長期投与したところ、投与しないラットに比べて有意に血圧低下作用を有することが明らかとなった。
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Serum cholesterol reduction by feeding a high-cholesterol diet containing a lower-molecular-weight polyphenol fraction from peanut skin Reviewed
Tomoko Tamura, Naoko Inoue, Akiko Shimizu-Ibuka, Miki Tadatoshi, Toshichika Takita, Soichi Arai, and Kiyoshi Mura
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 76 834 - 837 2012.04
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ラッカセイ種皮熱水抽出物のポリフェノール含有画分は、高コレステロール食ラットの血中コレステロール上昇を抑制し、糞中コレステロールを増加させた。この効果は、ラッカセイ種皮抽出物を分子量10,000で分画した際、低分子画分に強く観察された。また、ラッカセイ種皮ポリフェノールは、コレステロールを不溶化することで腸管からその吸収を阻害し、糞中へのコレステロール排泄を増加させることで血中コレステロールの上昇を抑制することを示した。
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Global gene expression profiles in developing soybean seeds Reviewed
Tomiko Asakura, Tomoko Tamura, Kaede Terauchi, Tomoyo Narikawa, Kazuhiro Yagasaki, Yoshiro Ishimaru, Keiko Abe
Plant Physiology and Biochemistry 52 147 - 153 2012.01
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
種子の発生の生理メカニズムをあきらかにするために、ダイズが登熟し種実を形成する際に変動する遺伝子プロファイリングをＤＮＡマイクロアレイ解析により得た。種子貯蔵タンパク質、成熟タンパク質、プロテアーゼインヒビター、アレルゲンタンパク質、リポキシゲナーゼに関与する遺伝子が発現変動していたことが明らかとなり、発生における分子基盤を得た。
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Effects of Peanut-skin Procyanidin A1 on Degranulation of RBL-2H3 Cells Reviewed
Keisuke Tomochika, Akiko Shimizu-Ibuka, Tomoko Tamura, Kiyoshi Mura, Naoki Abe, Jun-ichi Onose, and Soichi Arai
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2011.09
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ラッカセイ種皮の分子量10,000以下の低分子画分(PSEL)に、抗アレルギー作用が認められた。そこで各種クロマトグラフィーで主要ポリフェノールを単離し、1H NMR と13C NMRのスペクトル解析を行いプロシアニジンA1を同定した。プロシアニジンA1の脱顆粒阻害活性はIC50値が20.3µMであり、プロテインキナーゼCの活性化あるいは細胞内ストアからのカルシウムイオン放出後の反応を阻害した。
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Expression of the stress-related genes for glutathione S-transferase and ascorbate peroxidase in the glycinin-deficient Nanahomare soybean cultivar during seed maturation Reviewed
Tomoyo Narikawa, Tomoko Tamura, Kazuhiro Yagasaki, Kaede Terauchi, Kazutsuka Sanmiya, Yoshiro Ishimaru, Keiko Abe, and Tomiko Asakura
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 74 1976 - 1979 2010.08
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ナナホマレと親品種のタマホマレの完熟種子の成分分析を行ったところ、ナナホマレでは遊離アミノ酸含有量が著しく高かった。両品種から伸長を開始した莢、豆(2mm)、豆(5mm)、枝豆（最大サイズ）のRNAを抽出し、DNAマイクロアレイ解析を行うとglutathione S-transferase (GST)とascorbate peroxidase (APX)などのストレス関連遺伝子がナナホマレで有意に高い発現を示した。
DOI： 10.1271/bbb.100479
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Utilization of oryzacystatin for regulating the ripening of squid shiokara, a traditional Japanese salted and fermented seafood Reviewed
Junko Funaki, Tomoko Tamura, Mizuho Nishinoaki, Takumi Misaka, Wakako Eto, and Tomiko Asakura
Journal of Food Science 2010.01
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
保蔵食品であるイカの塩辛が熟成する際に、イカ肉タンパク質はイカ肝臓のプロテアーゼの加水分解を受ける。とりわけ筋組織のパラミオシンとミオシン重鎖はシステインプロテアーゼにより断片化される。本実験ではオリザシスタチン添加が、パラミオシンとミオシン重鎖の分解を制御し、塩辛の熟成と食した際の弾性に影響することを示した。
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Relationship between tissue structural collapse and disappearance of flesh transparency during postmortem changes in squid mantles Reviewed
Mutsuko Kugino, Kenji Kugino, Tomoko Tamura, and Tomiko Asakura
Journal of Food Science 74 495 - 501 2009.08
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
漁獲後のイカを消費地まで輸送する方法の違いがイカ肉の鮮度と物性にどのような影響を与えるかを検討した。即殺し冷蔵輸送・冷蔵輸送・冷海水輸送・活魚輸送の4条件を検討した結果、漁獲
後即殺することでATP量、筋組織構造、肉の透明度が保たれることが判明した。 -
Signal peptide peptidases are expressed in the shoot apex of rice, localized to the endoplasmic reticulum Reviewed
Tomoko Tamura, Masaharu Kuroda, Tetsuo Oikawa, Junko Kyozuka, Kaede Terauchi,Yoshiro Ishimaru , Keiko Abe, and Tomiko Asakura
Plant Cell Report 28 1615 - 1621 2009.07
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
本研究では、イネから初めてシグナルペプチドペプチダーゼ（SPP）を単離同定した。SPPは魚類・哺乳類を含め広く生物に存在する、細胞膜複数回貫通型アスパラギン酸プロテアーゼで、動物では免疫に関与する。植物における生理作用を明らかにするために、植物SPP(OsSPPと命名)とそのホモログを単離した。OsSPPの細胞内局在は小胞体であった。一方ホモローグはエンドソームに局在した。OsSPPは植物の地上部位すべての形態形成をする茎頂分裂組織に強く発現し、その生理作用は植物の発生および分化といった生命の根幹に関わっていた。
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Cathepsin D-like aspartic proteinase occurring in a maize weevil, Sitophilus zeamais, as a candidate digestive enzyme Reviewed
Ichiro Matsumoto, Tomiko Asakura, Toshiaki Ohmori, Tomoko Tamura, and Keiko Abe
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 73 2338 - 2340 2009.07
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
コクゾウ虫は米やトウモロコシに寄生し繁殖する。本研究では、コクゾウ虫の消化管抽出物にアスパラギン酸プロテアーゼ活性が存在し、本酵素が米の主要な貯蔵タンパク質であるグルテリンを水解することを見出した。さらにコクゾウからアスパラギン酸型プロテアーゼをコードするcDNAクローンを1種得て、このクローンが幼虫の前腸および成虫の中腸と盲嚢において強く発現することをin situ hybridisationにより明らかにした。
DOI： 10.1271/bbb.90372
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Wheat cysteine proteases triticain α, β and γ exhibit mutually distinct responses to gibberellins in germinating seeds
Toshihiro Kiyosaki, Tomiko Asakura, Ichiro Matsumoto, Tomoko Tamura, Kaede Terauchi, Junko Funaki, Masaharu Kuroda, Takumi Misaka, and Keiko Abe
Journal of Plant Physiology 166 101 - 106 2008.02
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
コムギから3つのシステインプロテアーゼtriticain α、β 、γ を単離した。triticain α、γは吸水後2日目から胚全体に発現する一方、triticain βは吸水後数時間から発現した。また、triticain α、γはジベレリン合成阻害剤であるウニコナゾールの存在下で発現が減少した。このことから同じシステインプロテアーゼファミリーであっても発芽時において発現時期やジベレリン応答性を異にして機能することが判明した。
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Application of an Aspergillus saitoi protease preparation to soybean curd to modify its functional and rheological properties Reviewed
Mizuho Nishinoaki, Tomiko Asakura, Tomom Watanabe, Etsuko Kunizaki, Mami Matsumoto, Wakako Eto, Tomoko Tamura, Michiko Minami, Akio Obata, Keiko Abe, and Junko Funaki
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 72 587 - 590 2007.11
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
醤油酵素Aspergillus saitoi由来の酵素製剤モルシンは、アスパラギン酸プロテアーゼを主成分とし、食品タンパク質の改質を行なう目的で製造されたが、プロテアーゼ活性の他にβ-グルコシダーゼ活性を併せ持つことが本研究で初めて
明らかになった。このモルシンを豆腐に
作用させることで、豆腐中の機能性食品因子である配糖体型イソフラボンを易吸収性のアグリコンに変換し、生理機能を高めた豆腐を生産することに成功した。 -
Signal peptide peptidase and its homologues in Arabidopsis thaliana - plant tissue-specific expression and distinct subcellular localization Reviewed
Tomoko Tamura, Tomiko Asakura, Tomohiro Uemura, Takashi Ueda, Kaede Terauchi, Takumi Misaka, and Keiko Abe
FEBS Journal 275 34 - 43 2007.10
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
シグナルペプチドを部分水解して有用な生体機能物質をつくり出すペプチダーゼ（signal peptide peptidase: SPP）はごく最近になって動物から見い出されたユニークな酵素である。本論文ではまずシロイヌナズナのデータベースから1つのSPP（AtSPP）と5つのSPPホモローグを見い出しAtSPPは未分化組織である茎頂に、ホモローグは茎頂の周辺に発現することを示した。またSPPは小胞体に、ホモローグはエンドソームに局在した。SPPは生体機能物質の産出の役割をもつペプチダーゼであり、本研究で初めて植物SPPが発見された
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Differential expression of wheat aspartic proteinases, WAP1 and WAP2, in germinating and maturing seeds Reviewed
Tomoko Tamura, Kaede Terauchi, Toshihiro Kiyosaki, Tomoko Asakura, Junko Funaki, Ichiro Matsumoto, Takumi Misaka, and Keiko Abe
Journal of Plant Physiology 164 470 - 477 2006.02
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
コムギからアスパラギン酸プロテアーゼ（WAP）を単離した。WAPは、プロラミンに属する難消化性タンパク質であるグリアジン画分をよく水解した。またWAPのin situハイブリダイゼーションの結果、WAPは登熟・発芽時の胚の幼根や幼芽に特に強く発現し細胞分裂が盛んな時期の胚で機能することを示した。これらから、WAPはコムギの生命活動に重要なだけでなく、食物に添加した際に難消化性のグリアジンを水解し消化吸収の向上に寄与することをしめした。
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Plant-specific insertions in the soybean aspartic proteinases, soyAP1 and soyAP2, perform different functions of vacuolar targeting Reviewed
Kaede Terauchi, Tomiko Asakura, Haruko Ueda, Tomoko Tamura, Kentaro Tamura, Ichiro Matsumoto, Takumi Misaka, Ikuko Hara-Nishimura, and Keiko Abe
Journal of Plant Physiology 163 856 - 862 2005.08
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
消化酵素ペプシンや凝乳酵素キモシンは代表的な動物性アスパラギン酸プロテアーゼ（AP）である。植物のAPは、他の生物には存在しない、約100アミノ酸残基の挿入配列（PSI）を持つ。PSIの機能を明らかにすることにより植物性APを特徴付けることが可能だと考えた筆者らは、ダイズから2種類のAP、soyAP1とsoyAP2を単離した。その結果soyAP2のPSIのみが液胞輸送に関与することを明らかにした。