Papers - CHIBA Susumu
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Marine macroinvertebrate fauna of the shallow coastal waters of the Shiretoko Peninsula, a World Natural Heritage at Hokkaido, Japan Reviewed International journal
Sonoda T, Chiba S, Yamazaki T, Nobetsu T, Fujiya H, Komai T, Nunomura N, Shimomura M, Tomikawa K, Kakui K, Hosono T, Ito A, Fujita T, Kobayashi I, Goshima S
Plankton and Benthos Research 19 ( 1 ) 1 - 16 2024.03
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
知床半島の沿岸域の海産無脊椎動物相（299種）をはじめて報告した。本論文は、知床世界自然遺産区域における生物相変化のモニタリングにおける基準の１つとして利用される。
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Spatial and economic quantification of provisioning service by eelgrass beds in Lake Notoro, Hokkaido, Japan Reviewed International journal
Ito K, Sonoki S, Minami K, Chiba S, Shirakawa H, Kawajiri T, Zhu Y, Miyashita K
Scientific Reports 14 3742 2024.02
能取湖（網走市）のアマモ場の空間構造を音響手法を用いて明らかにし、その構造とホッカイエビ（北海しまえび）の現存量との関係から、アマモ場の生態系サービス（供給サービス）を推算した。
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Effects of heatwave events on the seagrass-dwelling crustacean Pandalus latirostris in a subarctic lagoon. Reviewed International journal
Matsumoto H, Azuma N, Chiba S
Marine Environmental Research 192 106226 2023.10
Authorship：Last author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Mechanisms that can cause population decline under heavily skewed male-biased adult sex ratios Reviewed International journal
Chiba S*, Iwamoto A, Shimabukuro S, Matsumoto H, Inoue K
Journal of Animal Ecology 92 ( 9 ) 1893 - 1903 2023.09
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Life history of the freshwater shrimp, Palaemon paucidens, in the Nishimoune River, Kesennuma, Japan. Reviewed
Katogi, Y., Matsumoto, H., Takahashi, M., Azuma, N., Chiba, S.
Japanese Journal of Benthology 77 27 - 37 2022.12
Authorship：Last author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Genetic differentiation between Palaemon septemtrionalis populations of two rivers examined by newly developed short tandem repeat markers Reviewed International journal
Azuma, N., Kuroda, M., Katogi, Y., Chiba, S.
Crustacean Research 51 123 - 127 2022.11
Authorship：Last author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
キタノスジエビ Palaemon septemtrionalisを対象にSTR遺伝マーカーを開発し、集団間で比較を行った。
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Predation risk management of sea stars (Asterias amurensis and Distolasterias nipon) by adjusting the density and size of seeded scallops (Mizuhopecten yessoensis): An improvement to local mariculture Reviewed International journal
Miyoshi K, Chiba S
Aquaculture International 2021.11
Authorship：Last author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
北海道オホーツク海沿岸部におけるホタテガイの地まき放流漁業は、日本のホタテガイ生産の約50％を占めている。ホタテガイの稚貝放流後は人為的に管理することは困難であるため、生産性を上げるためには放流前の技術を改良する必要がある。本研究ではヒトデ類による捕食被害を想定した稚貝の最適な放流数、大きさおよび密度を推定した。
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Combining UAV and satellite image for monitoring drifting ice Reviewed International journal
Matsumura K, Chiba S, Avtar R, Matoba S, Ichinose T, Morikawa K
Okhotsk Sea and Polar Oceans Research 5 36 - 40 2021.01
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
能取湖の湖氷が解ける際の氷によるアマモ場の撹乱の様子をUAVを用いて撮影し、UAVとAgriforetell のシステムを併用した植生や流氷観測の可能性を示した。
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Interactions between predatory sea stars (Asterias amurensis and Distolasterias nipon) and Japanese scallops (Mizuhopecten yessoensis) and implications for scallop seeding in mariculture. Reviewed International journal
Miyoshi, K., Kuwahara, Y., Chiba, S.
Aquaculture Research 50 ( 9 ) 2419 - 2428 2019.05
Authorship：Last author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ホタテガイに対するマヒトデとニッポンヒトデの捕食インパクトを明らかにすることを目的に、それらの捕食率と捕食量の定量、およびインパクトの種間比較を行った。両ヒトデ種ともに小さいホタテガイを好み、捕食インパクトは水温上昇に応じて高くなった。ただし、ニッポンヒトデの方がより大きな捕食インパクトを有していた。本研究は、地まき増殖システムにおける放流ホタテガイの生存率の改善に寄与する情報を提示した。
DOI： 10.1111/are.14195
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A new freshwater shrimp species of the genus Palaemon Weber, 1795 (Decapoda: Caridea: Palaemonidae) from northeastern Japan. Reviewed International journal
Katogi, Y., Chiba, S., Yokoyama, K., Hatakeyama, M., Shirai, S., Komai, T.
Zootaxa 4576 ( 2 ) 239 - 256 2019.04
Authorship：Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
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Predatory behavior of the sea stars Asterias amurensis and Distolasterias nipon on the Japanese scallop, Mizuhopecten yessoensis Reviewed International journal
Nisihmura H, Miyoshi K, Chiba S*
Plankton and Benthos Research 14 ( 1 ) 1 - 7 2019.02
Authorship：Last author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
DOI： 10.3800/pbr.14.1
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Genetic population structure of Hokkai shrimp, Pandalus latirostris Rathbun 1902, inhabiting Zostera seagrass beds along the coast of eastern Hokkaido Reviewed International journal
Azuma N, Chiba S
Journal of Crustacean Biology 38 ( 2 ) 147 - 155 2018.03
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ホッカイエビ（水産ブランド名、北海しまえび）の６つの個体群を対象にして集団遺伝構造を調べた。ミトコンドリアDNAの調節領域と核DNAのマイクロサテライト領域の遺伝マーカーを用いて解析した結果、ホッカイエビの個体群間に遺伝的な変異があることを明らかにした。その変異の程度は大きくなかったが、地域個体群間での本種の頻繁な移出入は否定された。本研究の結果は（１）本種の保全や資源管理の基本は地域個体群であること、（２）本種の種苗放流などは慎重に行う必要があることを明確にした。
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Spatial-temporal variations in the composition of two Zostera species in a seagrass bed: Implications for population management of a commercially exploited grass shrimp Invited Reviewed International journal
Yusa T, Shoji J, Chiba S*
Fisheries Science 84 ( 2 ) 261 - 273 2018.03
Authorship：Last author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
アマモとスゲアマモ両海草種の組成の時空間変異を調べ、それらの生息場所としての質を考察した。長期間隔での比較では各種の相対量と分布域は湖内で大きく変化していた。短期ではスゲアマモの量はアマモの量、水深、地点の影響を受けており、海草種間で構造差が観察された。有用種であるホッカイエビ（北海シマエビ）はスゲアマモで多かった。本研究は海草の種構成の変化が藻場の生息場所としての質に影響しうることを示した。
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Day-night change in fish community structure in a seagrass bed in subarctic waters Reviewed International journal
Tanaka H, Chiba S, Yusa T, Shoji J
Fisheries Science 84 ( 2 ) 275 - 281 2018.03
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
季節・昼夜ごとの魚類相調査と生物・物理環境調査を北海道能取湖のアマモ場で実施した．魚食性魚類の平均種数，分布密度，湿重量，および魚類群集の平均栄養段階は，調査したすべての季節において日中に比べて夜間に大きく，外部生態系からアマモ場へ魚食性魚類が訪問することにより，稚魚・小型魚類の被食リスクが夜間に増大することが示唆された．アマモ場は，日中には稚魚・小型魚類の被食シェルターとなる一方で，夜間には水産業上重要な魚食性魚類の摂餌場としても機能する可能性がある．
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Importance of patch size variation for the population persistence of a decapod crustacean in seagrass beds Reviewed International journal
Shinomiya Y, Chiba S*, Kanamori M, Hashizume S, Yoshino K, Goshima S
Marine Ecology Progress Series 570 157 - 171 2017.04
Authorship：Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
沿岸生態系の保全を考える上で、海草藻場の管理は重要な課題のひとつであり、数多くの研究が行われている。しかし、水産有用種の個体群の管理・保全という観点から、海草藻場の管理を考えた例は少ない。
本研究では、ホッカイエビ（北海しまえび）にとって必要な海草（アマモとスゲマアモ）の集塊（パッチ）の大きさが、エビの成長段階に応じて異なっていることを明らかにし、エビ個体群の持続的な利用（漁獲）のためには、様々な大きさの海草パッチを保全すべきであることを示した。
*Corresponding authorDOI： 10.3354/meps12126
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Phylogeography of Littorina sitkana in the northwestern Pacific Ocean: evidence of eastward trans-Pacific colonization after the Last Glacial Maximum Reviewed International coauthorship International journal
Azuma N, Zaslavskaya NI, Yamazaki T, Nobetsu T, Chiba S
Genetica 145 ( 2 ) 139 - 149 2017.02
Authorship：Last author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
クロタマキビは、東北から北アメリカにかけて北太平洋の岩礁域に広く分布している。ミトコンドリアDNAを解析した結果、日本やロシアの北西太平洋のクロタマキビは数度の氷期－間氷期サイクルを乗り越えて存続してきたのに対し、北米の個体群は最終氷期以降に北海道周辺から千島・アリューシャン列島を経てアラスカに到達し、北米沿岸まで広まった可能性が非常に高いと考察した。
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Population divergence in cold tolerance of the intertidal gastropod Littorina brevicula explained by habitat-specific lowest air temperature Reviewed International journal
Chiba, S*., Iida, T., Tomioka, A., Azuma, N., Kurihara, T., Tanaka, K.
Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 481 49 - 56 2016.05
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
日本列島に広く分布しているタマキビ（巻貝）の耐寒性を調べ、経験する最低気温が低くなるほど（概ね北方個体群になるほど）低温耐性が高いことを実験的に示した。
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Phylogeography of Littorina brevicula suggests post-glacial colonization from south to north along the Japanese Archipelago Reviewed International journal
Azuma N, Chiba S
Journal of Molluscan Studies 82 ( 2 ) 259 - 267 2016.05
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
タマキビは日本列島に広く分布する巻貝であるが、本研究の結果、大きなスケールでは地域間で遺伝的変異があることが明らかになった。また南ほど遺伝的多様性が高い傾向にあり、最終氷期以降に、タマキビ集団は南から北へ徐々に北進した可能性を提唱した。
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Mollusks in Sakhalin Island, Russia, with special notes on the occurrence of Mya baxteri Coan & Scott,1997 and Zirfaea crispata (Linnaeus, 1758) Reviewed
45 262 - 283 2015.02
Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
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北海道東部の藻場におけるアミ類種組成の空間変異 Reviewed
遊佐貴志・千葉晋
日本ベントス学会誌 69 18 - 22 2014.06
Authorship：Last author Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
北海道東部の海跡湖、沿岸域においてアミ類の種組成を調べ、比較した。
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Predation impact of small drilling gastropods on the Japanese scallop, Mizuhopecten yessoensis Reviewed International journal
Chiba, S.*, Arai, Y.
Journal of Shellfish Research 33 ( 1 ) 137 - 144 2014.04
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ホタテガイの捕食者に関しては科学的知見が非常に不足している。本研究は、小さな巻貝がホタテガイの捕食者になりうることを初めて報告し、一部の海域では無視できないほどの影響をもたらしていることを示した。
DOI： 10.2983/035.033.0113
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Maladaptive sex ratio adjustment by a sex-changing shrimp in selective-fishing environments Reviewed International journal
Chiba S*, Yoshino K, Kanaiwa M, Kawajiri T, Goshima S
Journal of Animal Ecology 82 ( 3 ) 632 - 641 2013.05
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
漁獲による非意図的な選択性がきっかけで、ホッカイエビ（北海しまえび）の性比が大きく歪むこと、その歪みに応じてエビが性比調節するように性転換のタイミングを変えること、しかしその調節は十分でないか、漁獲環境下ではむしろ非適応的（進化的に好ましくない）応答であることを示した。
この論文はJournal of Animal Ecology 82(3)において、注目すべき論文（In Focus）として巻頭レビューされた(DOI: 10.1111/1365-2656.12074)。 -
Development and usage of microsatellite markers for population analysis of Corbicula japonica in Japan. Reviewed International journal
Azuma N, Chiba S, Nakagawa T, Sonoda T
Plankton and Benthos Research 7 ( 3 ) 151 - 157 2012.08
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ヤマトシジミのマイクロサテライト領域遺伝マーカーを開発し、集団比較を行った。
DOI： 10.3800/pbr.7.151
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Mitochondrial and nuclear DNA analysis revealed a cryptic species and genetic introgression in Littorina sitkana (Mollusca, Gastropoda) Reviewed International journal
Azuma N, Yamazaki T, Chiba S
Genetica 139 ( 11-12 ) 1399 - 1408 2011.12
Authorship：Last author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
形態的にクロタマキビ（巻貝）と同定される個体の遺伝子を調べたところ、大きく２グループ（clade）に分かれた。特に知床半島では、ミトコンドリアDNAと核DNAの結果から、同所的に生息しているにも関わらずグループ間で繁殖していない（繁殖隔離がある）こと、さらにその他に、以前に交配していたが近年交配しなくなったと考えられる個体（隠ぺい種）が存在することを明らかにした。
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Expression profiling without genome sequence information in a non-model species, pandalid shrimp (Pandalus latirostris), by next-generation sequencing Reviewed International journal
Kawahara-Miki R, Wada K, Azuma N, Chiba S*
PLoS ONE 6 e26043 2011.10
Authorship：Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ゲノム情報の無い非モデル生物であるホッカイエビ（北海しまえび）を対象に、個体群間の表現型変異に起因する遺伝子の探索における次世代シーケンサーの有用性を示した。
*Corresponding author -
Area-specific temporal changes of species composition and species-specific range shifts in rocky-shore mollusks associated with warming Kuroshio Current Reviewed International journal
Kurihara T, Takami H, Kosuge T, Chiba S, Iseda M, Sasaki T
Marine Biology 158 ( 9 ) 2095 - 2107 2011.09
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
日本列島の軟体動物を対象に、地球温暖化にともなって低緯度の種が高緯度に分布域を拡大しているかどうかを調べた。温暖化か確認された南の15海岸中のうち11海岸で南方種が北へ分布域を広げていた。種の緯度的な分布範囲は基本的に増加していたが、種間変異も大きかった。これらの変異には調査域の特徴的な潮流や系統的な制約が関係していると考えられる。
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Isolation and characterization of 13 polymorphic microsatellites for the Hokkai Shrimp, Pandalus latirostris. Reviewed International journal
Azuma N, Seki Y, Kikkawa Y, Nakagawa T, Iwata Y, Sato T, Munehara H, Chiba S*
Conservation Genetics Resources 3 529 - 531 2011.05
Authorship：Last author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ホッカイエビにおいて多型のあるマイクロサテライトDNA領域を単離し、特性を記載した。寒海域で最も漁獲されているタラバエビ属の中でも最初の報告である。
*Corresponding author -
Molecular cloning of acetylcholinesterase gene from Salicornia europaea L. Reviewed International journal
Yamamoto, T, Oguri, S, Chiba, S, Momonoki, Y.
Plant Signaling & Behavior 4:361-366 4 361 - 366 2009.05
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
Slicornia europaea L.(アッケシソウ)のアセチルコリンエステラーゼ(AChE)遺伝子を精製し，そのタンパク質をコードする遺伝子を単離したmaize AChEとsiratro AChEのホモログ遺伝子を基にし，RT-PCR法を用いて同定した．Salicornia AChE全ｃDNA配列は1441bp，シグナルペプチドを含む387残基のタンパク質をコードしていた．maizeおよびsiratroAChEsと同様に動物AChEとは異なるlipase GDSL familyに属していた． (Yamamoto K, Oguri S, Chiba S, Momonoki, Y)
DOI： 10.4161/psb.4.5.8360
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Coevolution of foraging behavior with intrinsic growth rate: risk-taking in naturally and artifically selected growth genotypes of Menidia menidia International coauthorship International journal
Chiba S*, Arnott SA, Conover DO
Oecologia 154 237 - 246 2007.11
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
成長速度と採餌行動の共進化を証明した初めての事例。同種でも早い成長率が進化した個体群は基本的には臆病で、状況に応じて危険な採餌行動のリスクを補償していた。さらに、（漁業のような）自然ではない淘汰圧によって変化した成長率は、動物の行動を非適応的に進化させうることも示唆した。先駆的な研究としてFaculty of 1000 Biologyに選出された。
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A review of ecological and evolutionary studies on hermaphroditic decapod crustaceans Invited Reviewed International journal
Chiba, S
Plankton and Benthos Research 2 107 - 119 2007.08
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
十脚目甲殻類（エビ類）の雌雄同体に関する初のレビュー。2007年現在までに報告されている雌雄同体のエビをリスト化し、さらに、それらの進化に関する理論と、演繹（えんえき）的な報告例を全て解説した。(Chiba S.)
DOI： 10.3800/pbr.2.107
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Evolution of intrinsic growth rate: Metabolic costs drive tradeoffs between growth and swimming performance in Menidia menidia Reviewed International coauthorship International journal
Arnott SA, Chiba S, Conover DO
Evolution 60 1269 - 1278 2006.06
Authorship：Lead author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
魚類を対象に、代謝コストが起因して成長速度と運動能力がトレードオフの関係になることを明らかにした。この結果は、動物の成長が最大化されずに最適化される（成長率の進化）うえでの一般的な現象だと考えられる。(Arnott SA, Chiba S, Conover DO)
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Maladaptive changes in multiple traits caused by fishing: impediments to population recovery Reviewed International coauthorship International journal
Walsh M, Munch SB, Chiba S, Conover DO
Ecology Letters 9 142 - 148 2006.02
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
漁業に起因した不自然な進化（maladaptation）が、水産有用種の様々な形質で起こることを実験的に証明した。現在のように、大きな魚介類から優先的に漁獲していくと、自然では生き残りにくい子孫を優先的に残していくことになる。これは、禁漁を行っても、一度減ってしまった水産資源は容易に回復しないことを示唆すものであり、現在の水産資源の現状をよく説明している。(Walsh M, Munch SB, Chiba S, Conover DO)
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Response to dissolved oxygen, salinity and turbidity of the pandalid shrimp Pandalus latirostris Reviewed International journal
Chiba S*, Aoki L, Ogata T
Fisheries Science 70 1174 - 1176 2004.12
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ホッカエイビの溶存酸素，塩分，濁度への耐性の記載。
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Population structure and seasonal growth of the protandrous pandalid shrimp Pandalus latirostris in Notoro Lagoon, Hokkaido Reviewed
Chiba S*, Goshima S
Aquaculture Science（水産増殖） 51 375 - 383 2003.12
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
能取湖に生息するホッカイエビの個体群構造と成長の記載。
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Male-male competition selects delayed sex change in the protandrous pandalid shrimp Pandalus latirostris Reviewed International journal
Chiba S*, Goshima S, Shinomiya Y
Marine Biology 142 1153 - 1157 2003.06
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
ホッカイエビを例に，性転換を遅らせる大型の雄が出現する適応的意義を実験的に証明。繁殖期の雄は雌を巡って争い，大型の雄ほど繁殖成功が高いことを明らかにした。
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Macrobenthos community structure of the Tokachi coastal lagoons, northern Japan Reviewed
Japanese Journal of Limnology 64 11 - 20 2003.01
Language：Japanese Publishing type：Research paper (scientific journal)
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The magnitude of natural recruitment in a cultures population of Japanese scallop Patinopecten (Mizuhopecten)yessoensis on Yubetsu seabed (Japan), Sea of Okhotsk Reviewed
Paturusi A, Chiba S, Goshima S
Benthos Research 57 69 - 75 2002.12
Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
地まき放流ホタテガイ漁場における天然貝の加入の影響を推定。天然貝の加入は資源管理上，必ずしも好ましいことではないと結論付けた。
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Evolutionary ecology of life history variation in the protandrous pandalid shrimp Pandalus latirostris Reviewed
千葉 晋
北海道大学大学院 博士論文 2001.09
Language：English Publishing type：Thesis (other)
ホッカエイビの成熟・性転換タイミングの年変動を進化生態学的アプローチから説明。成長量，雌雄の割合，漁業活動が、エビの生活史変動に大きく関与していることを明らかにした。
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Reproductive cycle of the protandric pandalid shrimp Pandalus latirostris in Saroma Lagoon Reviewed International journal
Onishi Y, Chiba S*, Goshima S
Benthos Research 56 9 - 20 2001.06
Authorship：Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
サロマ湖に生息するホッカイエビの生殖周期を調査。オホーツク海沿岸群に特有な性転換を遅らせる雄の存在を確認した。 *Corresponding author
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Factors affecting the occurrence of early maturing males in the protandrous pandalid shrimp Pandalus latirostris Rathbun Reviewed International journal
Chiba S*, Goshima S, Mizushima T
Marine Ecology Progress Series 203 215 - 224 2000.09
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
通常よりも1年早く成熟するホッカイエビの雄の出現機構を解明。ふ化後，3ヵ月間の成長が，生涯の生活史に影響していた。
DOI： 10.3354/meps203215
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Factors maintaining topography-related mosaic of sessile epibenthos on a rocky shore Reviewed International journal
Chiba S*, Noda T
Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom 80 617 - 622 2000.08
Authorship：Lead author, Corresponding author Language：English Publishing type：Research paper (scientific journal)
岩礁海岸にみられる生物群集のパッチモザイク構造（生物の集まり）の維持機構を解明。モザイク維持には，岩礁の形と幼生加入量，同種の成体の存在が関与していた。
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「雄性先熟ホッカイエビPandalus kessleriの早熟雄の出現機構」 Reviewed
千葉 晋
北海道大学大学院 修士論文 1998.03
Language：Japanese Publishing type：Thesis (other)
ホッカイエビが雄として成熟するタイミングの年変動とその変動機構を解明。