論文 - 坂田 洋一
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Sensor histidine kinases mediate ABA and osmostress signaling in the moss Physcomitrium patens 査読あり
Tsukasa Toriyama, Akihisa Shinozawa, Yuki Yasumura, Masashi Saruhashi, Mayuka Hiraide, Shiori Ito, Hideyuki Matsuura, Keiko Kuwata, Mika Yoshida, Tadashi Baba, Izumi Yotsui, Teruaki Taji, Daisuke Takezawa, Yoichi Sakata
Current Biology 32 1 - 12 2022年01月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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CATALASE2 plays a crucial role in long-term heat tolerance of Arabidopsis thaliana 査読あり
Masaaki Ono, Kazuho Isono, Yoichi Sakata, Teruaki Taji
Biochemical and Biophysical Research Communications 534 747 - 751 2021年01月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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An ER-Golgi Tethering Factor SLOH4/MIP3 Is Involved in Long-term Heat Tolerance of Arabidopsis 査読あり
Kazuho Isono, Ryo Tsukimoto, Satoshi Iuchi, Akihisa Shinozawa, Izumi Yotsui, Yoichi Sakata, Teruaki Taji
Plant & Cell Physiology 62 ( 2 ) 272 - 279 2020年12月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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Activation of SnRK2 by Raf-like kinase ARK represents a primary mechanism of ABA and abiotic stress responses 査読あり
Mousona Islam, Takumi Inoue, Mayuka Hiraide, Nobiza Khatun, Akida Jahan, Keiko Kuwata, Sotaro Katagiri, Taishi Umezawa, Izumi Yotsui, Yoichi Sakata and Daisuke Takezawa
Plant Physiology 185 ( 2 ) 533 - 546 2020年12月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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Decoding ABA and osmostress signalling in plants from an evolutionary point of view 招待あり 査読あり
Kenji Komatsu, Daisuke Takezawa, Yoichi Sakata
Plant, Cell & Environment 43 ( 12 ) 2894 - 2911 2020年12月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1111/pce.13869
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Genome-Wide Association Study and Genomic Prediction Elucidate the Distinct Genetic Architecture of Aluminum and Proton Tolerance in Arabidopsis thaliana 査読あり
Yuki Nakano, Kazutaka Kusunoki, Owen A Hoekenga, Keisuke Tanaka, Satoshi Iuchi, Yoichi Sakata, Masatomo Kobayashi, Yoshiharu Y Yamamoto, Hiroyuki Koyama, Yuriko Kobayashi
Frontiers in Plant Science 11 ( 405 ) 1 - 16 2020年08月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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Arabidopsis Raf-like kinases act as positive regulators of subclass III SnRK2 in osmostress signaling 査読あり
Shohei Katsuta, Goro Masuda, Hyeokjin Bak, Akihisa Shinozawa, Yoshiaki Kamiyama, Taishi Umezawa, Daisuke Takezawa, Izumi Yotsui, Teruaki Taji, Yoichi Sakata
Plant J 103 634 - 644 2020年04月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1111/tpj.14756
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Quantitative Imaging Reveals Distinct Contributions of SnRK2 and ABI3 in Plasmodesmatal Permeability in Physcomitrella patens 査読あり
Takumi Tomoi, Kensuke Kawade, Munenori Kitagawa, Yoichi Sakata, Hirokazu Tsukaya, Tomomichi Fujita
Plant & Cell Physiology 61 ( 5 ) 942 - 956 2020年02月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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Tuning water-use efficiency and drought tolerance in wheat using abscisic acid receptors 査読あり
Ryosuke Mega, Fumitaka Abe, June-Sik Kim, Yuuri Tsuboi, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi, Yoichi Sakata, Kousuke Hanada, Hisashi Tsujimoto, Jun Kikuchi, Sean R. Cutler, Masanori Okamoto
Nature Plants 5 153 - 159 2019年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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SnRK2 protein kinases represent an ancient system in plants for adaptation to a terrestrial environment 査読あり
Akihisa Shinozawa, Ryoko Otake, Daisuke Takezawa, Taishi Umezawa, Kenji Komatsu, Keisuke Tanaka, Anna Amagai, Shinnosuke Ishikawa, Yurie Hara, Yasuko Kamisugi, Andrew C. Cuming, Koichi Hori, Hiroyuki Ohta, Fuminori Takahashi, Kazuo Shinozaki, Takahisa Hayashi, Teruaki Taji, Yoichi Sakata
Communications Biology 2 30 2019年
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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Archetypal Roles of an Abscisic Acid Receptor in Drought and Sugar Responses in Liverworts 査読あり
Akida Jahan, Kenji Komatsu, Mai Wakida-Sekiya, Mayuka Hiraide, Keisuke Tanaka, Rumi Ohtake, Taishi Umezawa, Tsukasa Toriyama, Akihisa Shinozawa, Izumi Yotsui, Yoichi Sakata, Daisuke Takezawa
Plant Physiology 179 317 - 328 2019年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1104/pp.18.00761
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Abscisic Acid Acts as a Regulator of Molecular Trafficking through Plasmodesmata in the Moss Physcomitrella patens 査読あり
5. Munenori Kitagawa, Takumi Tomoi, Tomoki Fukushima, Yoichi Sakata, Mayuko Sato, Kiminori Toyooka, Tomomichi Fujita, Hitoshi Sakakibara
Plant Cell Physiol 11 ( 36 ) 738 - 751 2018年12月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1093/pcp/pcy249
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Phosphoproteomic profiling reveals ABA-responsive phosphosignaling pathways in Physcomitrella patens 査読あり
Anna Amagai, Yoshimasa Honda, Shinnosuke Ishikawa, Yurie Hara, Mayuri Kuwamura, Akihisa Shinozawa, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama, Daisuke Takezawa, Yoichi Sakata, Kazuo Shinozaki and Taishi Umezawa
The Plant Journal 94 699 - 708 2018年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
DOI： 10.1111/tpj.13891
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An Evolutionarily Conserved Abscisic Acid Signaling Pathway Regulates Dormancy in the Liverwort Marchantia polymorpha 査読あり
D. Magnus Eklund, Masakazu Kanei, Eduardo Flores-Sandoval, Kimitsune Ishizaki, Ryuichi Nishihama, Takayuki Kohchi, Ulf Lagercrantz, Rishikesh P. Bhalerao, Yoichi Sakata,3, John L. Bowman
Current Biology 28 3691 - 3699 2018年
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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NLR locus-mediated trade-off between abiotic and biotic stress adaptation in Arabidopsis 査読あり
Hirotaka Ariga, Taku Katori, Takashi Tsuchimatsu, Taishi Hirase, Yuri Tajima, Jane E. Parker, Rubén Alcázar, Maarten Koornneef, Owen Hoekenga, Alexander E. Lipka, Michael A. Gore, Hitoshi Sakakibara, Mikiko Kojima, Yuriko Kobayashi, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Kazuo Shinozaki, Yoichi Sakata, Takahisa Hayashi, Yusuke Saijo, Teruaki Taji
Nature Plants 3 17072 2017年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
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Large-scale proteome analysis of abscisic acid and ABSCISIC ACID INSENSITIVE3-dependent proteins related to desiccation tolerance in Physcomitrella patens. 査読あり
I. Yotsui, S. Serada, T. Naka, M. Saruhashi, T. Taji, T. Hayashi, RS. Quatrano, Y. Sakata
Biochem Biophys Res Commun 2016年03月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
植物細胞の脱水耐性形質を支配する遺伝子同定のため、ヒメツリガネゴケのABA応答性脱水耐性形質を欠損するABI3欠損体を用いて、iTRAQ法を用いて大規模プロテオーム解析を行った。その結果、親水性LEAタンパク質、酸化還元酵素、脱水関連タンパク質が、脱水プロセスにおけるABI3欠損株において発現が欠損していることが明らかとなった。興味ふかいことに、これらタンパク質のオルソログはシロイヌナズナの成熟後期趣旨において特異的に発現していることが明らかとなり、これらタンパク質が植物細胞の脱水耐性形質発現に重要であることが示唆された。
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Plant Raf-like kinase integrates abscisic acid and hyperosmotic stress signaling upstream of SNF1-related protein kinase2 査読あり
1. M. Saruhashi, T. Kumar Ghosh, K. Arai, Y. Ishizaki, K. Hagiwara, K. Komatsu, Y. Shiwa, K. Izumikawa, H. Yoshikawa, T. Umezawa, Y. Sakata, D. Takezawa
Proc Natl Acad Sci USA 2015年11月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
蘚類ヒメツリガネゴケを材料に用いて、紫外線照射により得たABA非感受性株の原因遺伝子同定から明らかとなった、新規キナーゼの詳細な解析を行った。その結果、このキナーゼがSnRK2をリン酸化し活性化することで、ABAシグナル伝達を制御していることを明らかにした。また、シロイヌナズナのオルソログ遺伝子がABA非感受性株のABA感受性を回復させることから、本研究により明らかになた新規ABAシグナル伝達制御機構が陸上植物に広く保存されている可能性を示した。
その他リンク： http://www.pnas.org/content/early/2015/11/04/1511238112.abstract
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CSP41b, a protein identified via FOX hunting using Eutrema salsugineum cDNAs, improves heat and salinity stress tolerance in transgenic Arabidopsis thaliana. 査読あり
H. Ariga, T. Tanaka, H. Ono, Y. Sakata, T. Hayashi, T. Taji
Biochem Biophys Res Commun 464 318 - 323 2015年06月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
モデル植物であるシロイヌナズナと近縁の塩性植物 Eutrema salsugineumは極度の環境ストレスに耐える性質を有する。この環境ストレス耐性を付与する遺伝子群を明らかにするため、完全長cDNAライブラリーを作製し、シロイヌナズナに個別に過剰発現させた形質転換体を作出し、CSP41b遺伝子が耐熱性と耐塩性を向上させる遺伝子であることを明らかにした。
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Epoxycarotenoid-mediated synthesis of abscisic acid in Physcomitrella patens implicating conserved mechanisms for acclimation to hyperosmosis in embryophytes. 査読あり
D. Takezawa, N. Watanabe, T. Ghosh, M. Saruhashi, A. Suzuki, K. Ishiyama, S. Somemiya, M. Kobayashi, Y. Sakata
New Phytologist 206 209 - 219 2015年04月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
植物ホルモンであるアブシジン酸（ABA）は陸上植物の環境応答に必須の役割を持つ。ABAは陸上植物に普遍的に見出されるが、被子植物以外における合成経路は未知であった。本研究では被子植物のABA合成に重要な役割を持つゼアキサンチンエポキシ化酵素 (ZEP）のホモログ遺伝子をコケ植物ヒメツリガネゴケで見出し、その遺伝子破壊株を作出した。その結果、ZEP破壊株ではABAは検出限界以下に低下していたことから、カロテノイドを前駆体とする合成経路が陸上植物に進化的に保存されていることを明らかにした。
DOI： 10.1111/nph.13231
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Community analysis of picocyanobacteria in an oligotrophic lake by cloning 16S rRNA gene and 16S rRNA gene amplicon sequencing. 査読あり
Naoshi Fujimoto, Keigo Mizuno, Tomoki Yokoyama, Akihiro Ohnishi, Masaharu Suzuki, Satoru Watanabe, Kenji Komatsu, Yoichi Sakata, Naohiro Kishida, Michihiro Akiba, Satoko Matsukura
J. Gen. Appl. Microbiol. 2015年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
神奈川県宮ヶ瀬湖で増殖するピコシアノバクテリアの種を明らかにするため、16SリボソーマルRNA遺伝子および次世代シーケンサーによるメタゲノム解析を行った。その結果、Synechococcus sp. MW6B4が宮ヶ瀬湖における優占種であることが明らかとなった。
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Group A PP2Cs evolved in land plants as key regulators of intrinsic desiccation tolerance 査読あり
K. Komatsu, N. Suzuki, M. Kuwamura, Y. Nishikawa, M. Nakatani,H. Ohtawa, D. Takezawa, M. Seki, M. Tanaka, T. Taji, T. Hayashi, Y. Sakata
Nature Communications 4 2219 2013年07月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
栄養成長組織の脱水耐性は陸上植物の特徴であるが、維管束植物では失われている。モデル植物ヒメツリガネゴケの原糸体は急速な脱水に対して態勢を持たないが、植物ホルモンであるアブシジン酸（ABA）により強力な脱水耐性を獲得する。ABAシグナル伝達において負の制御を行う脱リン酸化酵素PP2Cを破壊したヒメツリガネゴケは成長が著しく抑制されるが、ABAに依存しない脱水耐性を有することが明らかとなった。このことは、PP2Cの陸上植物における出現が、植物が本来有する脱水耐性を抑制することを可能にし、環境変化に応じてABAにより抑制を解除する機構の獲得が陸上商物の進化に貢献したことが推察された。
DOI： 10.1038/ncomms3219
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Characterization of AtSTOP1 Orthologous Genes in Tobacco and Other Plant Species 査読あり
Y. Ohyama, H. Ito, Y. Kobayashi, T. Ikka, A. Morita, M. Kobayashi, R. Imaizumi, T. Aoki, K. Komatsu, Y. Sakata, S. Iuchi, H. Koyama
Plant Physiology 162 1937 - 1946 2013年06月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
酸性土壌における植物の生長阻害は、酸性条件で可溶化するアルミニウムイオンの毒性にある。転写因子STOP1はモデル植物シロイヌナズナの酸性土壌における酸耐性およびアルミニウム耐性に重要な働きを持つ。本論文では、進化的に異なる植物種からSTOP1遺伝子をクローニングし、シロイヌナズナstop1変異株を用いた機能相補実験を行った。その結果、STOP1機能はコケ植物を含めた陸上植物に保存されていることを明らかにした。
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Arabidopsis sos1 mutant in a salt-tolerant accession revealed an importance of salt acclimation ability in plant salt tolerance 査読あり
H. Ariga, T. Katori, R. Yoshihara, Y. Hase, S. Nozawa, I. Narumi, S. Iuchi, M. Kobayashi, K. Tezuka, Y. Sakata, T. Hayashi, T. Taji
Plant Signaling & Behavior 8 ( 7 ) e24779 2013年05月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
植物の耐ストレス塩性には、常に高いレベルの耐塩性を持つ恒常的耐塩性場合と、低濃度の塩に一定期間曝されることで誘導される耐塩性に分けることが出来る。本論文では、植物の恒常的耐塩性機構において重要な役割を持つことが示されているナトリウム輸送体SOS1が、塩馴化機構においては必須では無いことを明らかにし、両耐塩性が異なる機構を持つことが示唆された。
DOI： 10.4161/psb.24779
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ABSCISIC ACID INSENSITIVE3 regulates abscisic acid-responsive gene expression with the nuclear factor Y complex through the ACTT-core element in Physcomitrella patens 査読あり
I. Yotsui, M. Saruhashi, T. Kawato, T. Taji, T. Hayashi, R.S. Quatrano, Y. Sakata
New Phytologist 199 101 - 109 2013年04月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
植物固有の転写因子であるABI3は植物細胞の脱水耐性に重要な働きを持つ。本論文では、ヒメツリガネゴケABI3の転写活性化機構について分子生物学的解析を行った。その結果、ABI3はプロモーター上のACTTコア配列を標的配列としていることを明らかにした。その上で、ABI3と相互作用する因子としてCCAAT結合タンパク質NF-YCを同定し、NF-YC/NF/YB/ABI3が協調的にABA応答性遺伝子の転写活性化を行っていることを明らかにした。
DOI： 10.1111/nph.12251
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HsfA1d, a Protein Identified via FOX Hunting Using Thellungiella salsuginea cDNAs Improves Heat Tolerance by Regulating Heat-Stress- Responsive Gene Expression 招待あり 査読あり
Y. Higashi, N. Ohamab, T. Ishikawaa, T. Katori, A. Shimura,K. Kusakabe, K. Yamaguchi-Shinozaki, J. Ishida, M. Tanaka, M. Seki, K. Shinozaki, Y. Sakata, T. Hayashi, T. Taji
Molecular Plant 6 411 - 422 2013年02月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
塩性植物Thellungiella salsugineaは耐塩性のみならず、低温、高温、酸化ストレス等の非生物的ストレスに対して高い耐性を有する。Thellungiella salsugineaから調製した完全長cDNAライブラリーを用いて、個々の遺伝子を過剰発現した形質転換体を作出するFOXハンティングを行い、新規の耐熱性付与遺伝子として熱ショックタンパク質の一種であるHsfA1dを同定した。
DOI： 10.1093/mp/sst024
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A novel abi5 allele reveals the importance of the conserved Ala in the C3 domain for regulation of downstream genes and salt tolerance during germination in Arabidopsis. 査読あり
Kenji Tezuka, Teruaki Taji, Takahisa Hayashi, and Yoichi Sakata
Plant Signal Behav 8 ( 3 ) e23455 2013年01月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
シロイヌナズナを用いた耐塩性変異株のスクリーニングにより、ABAシグナル伝達系において働く転写因子ABI5の新規アリルを単離した。このabi5-9アリルでは、GroupA bZIPに広く保存されるC3領域において214番目のAlaがGlyに置換が起こっていた。abi5-9タンパク質はABI3との物理的相互作用が減少していたことから、214番目のAlaがABI3との相互作用に重要な役割を持つことが示唆された。
DOI： 10.4161/psb.23455
その他リンク： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3607608/
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Analyses of leaves from open field-grown transgenic poplars overexpressing xyloglucanase 査読あり
8. T. Kaku, K. Baba, T. Taniguchi, M. Kurita,K. Konagaya, K. Ishii, T. Kondo, S. Serada,H. Iizuka, R. Kaida, T. Taji, Y. Sakata, T. Hayashi
J Wood Sci 58 281 - 289 2012年02月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
Aspergillusのキシログルカナーゼ、AaXEG2を過剰発現させたポプラを野外試験にて評価した。キシログルカン量は肥料を与えない土壌で15-16%の低下、肥料を与えた土壌では21-22%の低下を示した。トランスジェニックポプラの葉は、野生型の葉と比較して、小さく、濃い緑色を示した。小さくなった原因としては複数種類のタンパク質量が減少していることと考えられた。
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Cold acclimation in the moss Physcomitrella patens involves abscisic acid-dependent signaling. 査読あり
Salma Begum Bhyan, Anzu Minami, Yasuko Kaneko, Shingo Suzuki, Keita Arakawa, Yoichi Sakata, and Daisuke Takezawa
J Plant Physiol 169 137 - 145 2012年
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
越冬する陸上植物は、一定期間の低温に曝されることにより凍結耐性を獲得する。この低温馴化における植物ホルモンアブシジン酸(ABA)の役割を明らかにするために、低温馴化能を示す基部陸上植物ヒメツリガネゴケのABA非感受性株を用いて解析した。その結果、ABA非感受性株の低温馴化能は著しく低下していることが示された。ABA非感受性株では、可溶性糖の蓄積は野生型株と同レベルであったが、親水性タンパク質(LEA)の蓄積が減少していた。このことから、ABAは低温馴化プロセスにおいてLEA遺伝子の発現に重要であることが示唆された。
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ABA in bryophytes: how a universal growth regulator in life became a plant hormone? 招待あり 査読あり
Daisuke Takezawa, Kenji Komatsu, and Yoichi Sakata
J Plant Res 124 ( 4 ) 437 - 453 2011年
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
近年のゲノム解読技術の進展を受けて、様々な植物種のゲノム情報が明らかになりつつある。植物の陸上化とABAシグナル伝達系の進化プロセスの関連性を明らかにするため、最新のゲノムデータを用いてABA合成・およびシグナル伝達に関連する遺伝子群を調査・比較した。その結果、ABA合成とシグナル伝達系の鍵遺伝子は陸上植物に特異的であることを示し、植物の陸上化にABA遺伝子群の進化が重要な役割を果たしたことを示唆した。
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Evolutionarily conserved regulatory mechanisms of abscisic acid signaling in land plants: Characterization of ABSCISIC ACID INSENSITIVE1-like type 2C protein phosphatase in the liverwort Marchantia polymorpha
K. Tougane, K. Komatsu, S. B. Bhyan, Y. Sakata, K. Ishizaki, K. T. Yamato, T. Kohchi, D. Takezawa
Plant Physiology 152 1529 - 1543 2010年03月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
ゼニゴケ (Marchantia polymorpha)の無性芽は葉状体と異なり、ABAに鋭敏に応答することを明らかにし、ゼニゴケからABI1型PP2C遺伝子を単離した。世界で初めてゼニゴケにおける一過的発現系を構築し、このPP2C遺伝子がABA応答の負の制御因子として機能することを明らかにし、今まで懐疑的に見られていた苔類におけるABA応答系を分子レベルで初めて示した。
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Dissecting the genetic control of natural variation in salt tolerance of Arabidopsis thaliana accessions 査読あり
T. Katori, A. Ikeda, S. Iuchi, M. Kobayashi, K. Shinozaki, K. Maehashi, Y. Sakata et al
Journal of Experimental Botany 61 1125 - 1138 2010年02月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
モデル植物であるシロイヌナズナは世界各地に自生し、それぞれの環境に適応したエコタイプ（accession）が収集、解析されている。自然界における塩ストレス耐性の分子機構を明らかにするため、シロイヌナズナのaccession344種の耐塩性を評価したところ、塩馴化能に優れたaccessionを発見した。遺伝学的解析から、この塩馴化能は優性1因子の支配であることが明らかになり、詳細なマッピングにより、その因子は第5染色体下腕部18.5Mbpの領域に位置することを明らかにした。
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Role of ABA and ABI3 in desiccation tolerance 査読あり
A. Khandelwal, S. H. Cho, H. Marella, Y. Sakata, P.-F. Perroud, A. Pan, R. S. Quatrano
Science 327 546 2010年01月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
種子の脱水耐性獲得に必須である植物ホルモンアブシジン酸（ABA）と転写因子ABI3のコケ植物ヒメツリガネゴケ (Physcomitrella patens)における役割を、遺伝子ターゲティング技術によりABI3欠損株を作出し、解析を行った。その結果、ABI3欠損株はABA誘導性の脱水耐性を完全に欠損することが明らかとなり、ABI3がコケ植物の乾燥耐性にも必須であることを示した。以上のことから、脱水耐性機構が陸上植物の進化を超えて保存されていることを示唆した。
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Regulation of the ABA-responsive Em promoter by ABI3 in the moss Physcomitrella patens: role of the ABA response element and the RY element 査読あり
Y. Sakata, I. Nakamura, T. Taji, S. Tanaka, R. S. Quatrano.
Plant Signaling & Behavior 5 1061 - 1066 2010年
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
モデル植物ヒメツリガネゴケ (Physcomitrella patens)において、シロイヌナズナABI3とヒメツリガネゴケABI3によるABA応答性プロモーターの活性化機構を比較し、両ABI3はRY配列を介した転写活性化能を有するが、シロイヌナズナABI3はABRE依存的にプロモーターを転写活性化し、ヒメツリガネゴケABI3にはない機能を有することが明らかとなった。以上の結果から、ABI3によるABA 応答性遺伝子の発現制御機構に関して進化的な知見を得た。
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Role of PP2C-mediated ABA signaling in the moss Physcomitrella patens 査読あり
Y. Sakata, K. Komatsu, T. Taji, S. Tanaka
Plant Signaling & Behavior 4 887 - 889 2009年09月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
モデル植物ヒメツリガネゴケ (Physcomitrella patens)において、シロイヌナズナABI1の変異型(abi1-1)を過剰発現させABA非感受性となったヒメツリガネゴケにおいて茎様体や造卵器の発達に異常が起こることを見出し、ABAシグナル伝達がコケ植物のストレス応答のみならず、通常環境下における発達制御に関与することを示した。
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Functional analyses of the ABI1-related protein phosphatase type 2C reveal evolutionarily conserved regulation of abscisic acid signaling between Arabidopsis and the moss Physcomitrella patens 査読あり
K. Komatsu, Y. Nishikawa, T. Ohtsuka, T. Taji, R. S. Quatrano, S. Tanaka, Y. Sakata
Plant Molecular Biology 70 327 - 340 2009年06月
担当区分：責任著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
モデル植物ヒメツリガネゴケ (Physcomitrella patens)において、シロイヌナズナABI1の変異型(abi1-1)を過剰発現させたところABA非感受性となり、種子植物のABA制御因子がコケ植物においても機能することを示した。さらに、ヒメツリガネゴケのABI1相同遺伝子であるPpABI1Aを遺伝子ターゲティングにより破壊したところ、ABA感受性が向上し、凍結耐性が向上していた。以上の結果から、ABAシグナル制御系が種子植物とコケ植物で保存されていることを初めて示した。
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Large-scale collection and annotation of full-length enriched cDNAs from a model halophyte, Thellungiella halophila. 査読あり
Taji T, Sakurai T, Mochida K, Ishiwata A, Kurotani A, Totoki Y, Toyoda A, Sakaki Y, Seki M, Ono H, Yoichi Sakata, Shigeo Tanaka, Kazuo Shinozaki
BMC Plant Biology 8 115 2008年11月
記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
モデル植物であるシロイヌナズナと近縁種である塩生植物Thellungiella halophilaを耐塩性研究のモデル植物として利用するための基盤整備を目的として、様々なストレスに曝したT. halophilaから抽出したRNAを用いて完全長cDNAライブラリーを作製した。二万クローンについて端読み塩基配列決定を行い、このライブラリーが9569の独立したクローンを含むことを明らかにした。さらにこれらの配列はシロイヌナズナの遺伝子との比較を行い、相同遺伝子のカタログ化を行った。研究者が利用できるリソースとして、これらのクローンとその情報は理研BRCを通じて公開予定である。
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Unique ethylene-regulated touch responses of Arabidopsis thaliana roots to physical hardness. 査読あり
Yamamoto C, Sakata Y, Taji T, Baba T, Tanaka S.
Journal of Plant Research 121 509 - 519 2008年09月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
植物根の接触屈性の分子機構を明らかにするために、寒天二層法と名付けた生物検定法を開発し、シロイヌナズナ根の接触屈性に関与する因子の探索を行った。接触屈性には植物ホルモンであるエチレンが関与することを、エチレンの合成変異株および感受性変異株を用いた解析から明らかにした。エチレン定量実験から、根が下層の寒天に接触して屈曲する時にはエチレン合成量が減少し、下層の寒天を突き抜ける時にはエチレン合成量が増加するという、負の相関性を見出した。
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Foliar trichome- and aquaporin-aided water uptake in a drought-resistant epiphyte Tillandsia ionantha Planchon. 査読あり
T. Ohrui, H. Nobira, Y. Sakata, T. Taji, C. Yamamoto, K. Nishida, T. Yamakawa et. al.
Planta 227 47 - 56 2007年12月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
エアープラントであるT. ionanthaが多量の水分を葉面から吸収することが可能であり、この吸収には葉面のトライコームを用いた短時間で多量の水分を吸収する段階と、それに続く、細胞内に水を取り込む緩やかな吸収段階の２段階が存在することを示した。さらに、第２段階の水分吸収には水輸送チャネルであるアクアポリンが関与していることを示した。T. ionanthaから水分に応答して発現が上昇するアクアポリン遺伝子 TiPIP2aをクローニングし、アフリカツメガエルの卵母細胞を用いた解析から、TiPIP2aの水輸送活性はリン酸化により制御されることを示した。
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Possible involvement of a bZIP protein in the repression of ABI3/VP1-mediated chymotrypsin inhibitor gene expression at the late-seed maturation in winged bean 査読あり
Y. Sakata, T. Kuwano, S. Takaoka, N. Takashima, T. Taji, H. Takenaga and S. Tanaka
Jour. Agri. Sci., Tokyo Univ. of Agric. 51 113 - 121 2006年12月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（大学，研究機関等紀要）
シカクマメからABI3/VP1様のタンパク質 (WbABI3)とbZIP型転写因子をクローニングし、その機能解析を行った。推定されるアミノ酸配列の解析から、このbZIP型転写因子 (WbZIP1)は、インゲンマメにおけるABI3/VP1を介した種子タンパク質遺伝子の転写活性化を抑制する転写因子ROM2と高い相同性を示すことが明らかにし、WbABI3とWbZIP1はそれぞれ正の制御因子および負の制御因子として、WCI遺伝子の種子成熟中期から後期にかけての一過的な発現を制御していることが示唆された。
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Characterization and functional analysis of ABSCISIC ACID INSENSITIVE3-like genes from Physcomitrella patens. 査読あり
H. H. Marella*, Y. Sakata*（*co-first authors）, R. S. Quatrano
The Plant Journal 46 1032 - 1044 2006年06月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
高等植物のアブシジン酸 (ABA)シグナル伝達経路において重要な役割を果たしているABI3の相同遺伝子 (PpABI3)をコケ植物ヒメツリガネゴケ (Physcomitrella patens)よりクローニングし、コケ植物においても高等植物と同様のABAシグナル伝達経路を保有していることを分子レベルで明らかにした。また、PpABI3が高等植物のABI3と同様の機能を持つことを、昨日相補実験により明らかにした。
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Arabinogalactan proteins are required for apical cell extension in the moss Physcomitrella patens. 査読あり
K. Lee, Y. Sakata, S-L. Mau, F. Pettolino, A. Bacic, R. S. Quatrano, C. D. Knight, J. P. Knox
The Plant Cell 17 3051 - 3065 2005年11月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
高等植物の細胞壁に含まれ、成長・分化への関与が示唆されているアラビノガラクタンタンパク質 (AGP)がコケ植物ヒメツリガネゴケ (Physcomitrella patens)にも存在することを初めて明らかにし、遺伝子ターゲティングによりPpAGP1遺伝子が原子体頂端細胞の先端成長に重要な働きをしていることを示した。
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Potential immunosuppressive and antiinflammatory activities of Malaysian medicinal plants characterized by reduced cell surface expression of cell adhesion molecules. 査読あり
S. Tanaka, Y. Sakata, L. Ao, M. Matumoto, K. Morimoto, N. Akimoto, G. Honda, M. Tabata et al
Phytotherapy Research 15 681 - 686 2001年12月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
細胞接着分子であるICAM-1とVCAM-1は、免疫細胞の細胞表面に特異的に発現し、免疫反応や炎症の形成に深く関与している。本分子の発現を抑制する物質は、現代病であるアレルギー性炎症やその慢性化に対する有効性が期待されることから、アルカロイド、テルペノイド、フェノール性化合物を含む種々の天然並びに合成化合物の作用を調査し、その構造活性相関を論じた。
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Influence of natural and synthetic compounds on cell surface expression of cell adhesion molecules, ICAM-1 and VCAM-1. 査読あり
S. Tanaka, Y. Sakata, K. Morimoto, Y. Tambe, Y. Watanabe, G. Honda, M. Tabata et al
Planta Medica 66 108 - 113 2001年03月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
細胞接着分子であるICAM-1とVCAM-1は、免疫細胞の細胞表面に特異的に発現し、免疫反応や炎症の形成に深く関与している。本分子の発現を抑制する物質は、現代病であるアレルギー性炎症やその慢性化に対する有効性が期待されることから、アルカロイド、テルペノイド、フェノール性化合物を含む種々の天然並びに合成化合物の作用を調査し、その構造活性相関を論じた。
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High affinity of the 5'-upstream region of a winged bean chymotrypsin inhibitor gene for nuclear matrix. 査読あり
M. Minami, G. Morisawa, M. Hayashi, Y. Sakata, Y. Habu, M. Iwabuchi, T. Meshi
Plant Cell Physiology 40 109 - 113 1999年01月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
WCI遺伝子の発現制御における核マトリクスの役割を解析する目的で，WCI遺伝子を解析したところ，WCI遺伝子の5'上流域は核マトリクス結合領域(MAR)活性を持つことが示された。一方，偽遺伝子であるWCI-P1は器官特異的な転写活性を持たないが，この遺伝子の5'上流域はMAR活性を示さなかった。このことは，WCI遺伝子の器官特異的な発現に，クロマチンレベルの制御が働いていることを示唆している。
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Transcription regulation of a Kunitz chymotrypsin inhibitor gene which is expressed abundantly in seeds and tuberous roots of winged bean.
Y. Sakata, S. Tamura, Y. Yamazaki, Y. Ohdaira, T. Kuwano, N. Takashima et al.
T. Ando et al. (Eds.) Plant nutrition - for sustainable food production and environment. 1997年09月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
WCIはシカクマメの種子および塊根に多量に蓄積し，茎にも少量蓄積する。種子の主要なWCIタンパク質をコードするWCI-3b遺伝子の5'上流域1.0kbpは形質転換タバコの成熟種子においてGUSレポーター遺伝子の高レベルの発現を誘導した。GUS活性は葉では認められなかったが，茎で発現が観られた。組織化学的解析よりGUS遺伝子は胚と茎の師部において発現していることが明らかとなった。これらの結果から，WCI遺伝子の胚と茎におけるには転写レベルの制御が働いており，そのシスエレメントは5'上流1.0kbpの領域に存在していることが示された。
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The RY sequence is necessary but not sufficient for the transcription activation of a winged bean chymotrypsin inhibitor gene in developing seeds.
Y. Sakata, Y. Chiba, H. Fukushima, N. Matsubara, Y. Habu, S. Naito, T. Ohno
Plant Molecular Biology ( 34 ) 1997年05月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
WCIはシカクマメの種子および塊根に多量に蓄積する。WCI遺伝子の特異的発現を制御する機構を解明するため，WCI-3b遺伝子の5'上流域の転写活性を形質転換タバコを用いて解析した。5'上流域より順次欠失させた解析より，転写開始点上流-882～-623の領域が種子における転写の活性化に関わるシスエレメントを複数もつことが示された。3'側から順次欠失させた解析から，WCI-3b遺伝子の種子における高レベルの転写の活性化には-882～-174の領域が必要であり，RY配列がシスエレメントの１つであることが示された。
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Evolution of a multigene family that encodes the Kunitz chymotrypsin inhibitor in winged bean:a possible intermediate in the generation of a new gene with a distinct pattern of expression.
Yoshiki Habu, Surin Peyachoknagul, Yoichi Sakata, Kazuhiro Fukasawa, Takeshi Ohno
Molecular & General Genetics ( 254 ) 1997年01月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
シカクマメの種子と塊根に蓄積するWCIをコードする遺伝子ファミリーのプロモーター領域の転写活性をトランスジェニックタバコを用いて解析した。その発現パターンから、主要なWCIタンパク質をコードするWCI-3遺伝子のみが種子において高い転写活性ををもち、他の遺伝子群は種子において弱い転写活性しかもたず、その内の１つは種子以外の器官における転写活性を獲得していることが明らかとなった。
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A gene encoding a major Kunitz proteinase inhibitor of storage organ of winged bean is also expressed in the phloem of stems.
Yosiki Habu, Hisayo Fukushima, Yoichi Sakata, Hisashi Abe, Ryo Funada
Plant Molecular Biology ( 32 ) 1996年12月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
WCIはシカクマメの種子及び塊根に多量に蓄積し、茎においても少量蓄積する。茎におけるWCIの蓄積組織を同定するため、シカクマメにおけるWCI抗体を用いた組織化学的解析から、WCIタンパク質は師部に蓄積していることが明らかとなった。また、トランスジェニックタバコを用いたGUSタンパク質の局在性の解析から、師部におけるWCI遺伝子の師部における発現には転写段階の制御が働いていることが明らかとなった。
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Transcriptional activities of a winged bean Kunitz chymotrypsin inhibitor gene in stable and transient expression systems.
Yoichi Sakata, Hisayo Fukushima, Yoshiki Habu, Shigeki Furuya, Satoshi Naito,Takeshi Ohno
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry ( 58 ) 1994年11月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
シカクマメの種子と塊根に蓄積するプロテアーゼインヒビター(WCI)遺伝子の発現をトランスジェニックタバコ種子およびシカクマメ種子におけるパーティクルガン法を用いて解析した。トランスジェニックタバコ種子における発現に重要な領域はシカクマメ種子における一過的な転写の活性化にはほとんど寄与しないことを報告し、これら2つの発現系は異なる制御機構を持つことを明らかにした。
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Ubiquitous nuclear proteins bind to 5'upstream region of major Kunitz chymotrypsin inhibitor gene in winged bean.
Yoshiki Habu, Yoichi Sakata, Kazuhiro Fukasawa, and Takeshi Ohno
Plant Molecular Biology ( 23 ) 1993年12月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
シカクマメの種子と塊根に蓄積する主要なプロテアーゼインヒビター(WCI-3)をコードする２つの遺伝子の5'上流域約1.1kbpの塩基配列は互いに99％の相同性を持つことを明らかにするとともに、この5'上流域に結合する２種類のDNA結合タンパク質をシカクマメ核抽出物より検出した。これら結合タンパク質がHMGタンパク質としての性質を有していることを報告した。
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Structure and regulated expression of Kunitz chymotrypsin inhibitor genes in winged bean [Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.].
Yoshiki Habu, Surin Peyachoknagul, Katsuhiro Umemoto, Yoichi Sakata, Takeshi Ohno
Journal of Biochemistry ( 111 ) 1992年02月
担当区分：筆頭著者 記述言語：英語 掲載種別：研究論文（学術雑誌）
シカクマメの種子と塊根に蓄積するプロテアーゼインヒビター(WCI)は多重遺伝子族によりコードされており、4つの機能的な遺伝子と3つの偽遺伝子から成ると推定された。WCIのmRNAおよびタンパクは成熟過程の種子および塊根で蓄積し、種子におけるmRNAの蓄積は成熟中期に一過的に起っていた。本論文により、WCI遺伝子の発現の器官特異性および時期特異性を明らかにした。